Balík: bali-phy (3.6.1+dfsg-2 a iné)

[ Zdroj: bali-phy  ]

Bayesian Inference of Alignment and Phylogeny

BAli-Phy estimates multiple sequence alignments and evolutionary trees from unaligned DNA, amino acid, or codon sequences. BAli-Phy uses MCMC to estimate evolutionary trees, positive selection, and branch lengths while averaging over alternative alignments. BAli-Phy can display alignment ambiguity graphically in an alignment uncertainty (AU) plot.

BAli-Phy can also estimate phylogenies from a fixed alignment (like MrBayes and BEAST) using substitution models like GTR+gamma. BAli-Phy automatically estimates relative rates for each gene.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom bali-phy

• dep: libboost-chrono1.71.0 [x32]

  Balík nie je dostupný

• dep: libboost-chrono1.74.0 (>= 1.74.0) [ia64]

  reprezentácia doby trvania, časového bodu a hodín v C++

• dep: libboost-chrono1.83.0t64 (>= 1.83.0) [nie ia64, x32]

  reprezentácia doby trvania, časového bodu a hodín v C++

• dep: libboost-filesystem1.71.0 [x32]

  Balík nie je dostupný

• dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0) [ia64]

  operácie so súborovým systémom (portabilné cesty, prechádzanie adresárov atď.) v C++

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0) [nie ia64, x32]

  operácie so súborovým systémom (portabilné cesty, prechádzanie adresárov atď.) v C++

• dep: libboost-program-options1.71.0 [x32]

  Balík nie je dostupný

• dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0) [ia64]

  knižnica volieb programu pre C++

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0) [nie ia64, x32]

  knižnica volieb programu pre C++

• dep: libboost-random1.71.0 [x32]

  Balík nie je dostupný

• dep: libboost-random1.74.0 (>= 1.74.0) [ia64]

  knižnica Boost náhodných čísel

• dep: libboost-random1.83.0 (>= 1.83.0) [nie ia64, x32]

  knižnica Boost náhodných čísel

• dep: libc6 (>= 2.29) [x32]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

• dep: libcairo2 (>= 1.4.10)

  2D vektorová grafická knižnica Cairo

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ppc64el, s390x]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, ppc64, sparc64, x32]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  podporná knižnica GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  podporná knižnica GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nie alpha, ia64, x32]

  štandardná knižnica C++ GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 14-20240221-2.1) [alpha]

  dep: libstdc++6 (>= 9) [ia64, x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  nnižnica na určenie na určenie postupnosti volania programu - dynamické súbory

• dep: perl

  Practical Extraction and Report Language od Larryho Walla

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• rec: gnuplot

  program na interaktívne kreslenie riadený z príkazového riadka
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11

• rec: r-base

  GNU R statistical computation and graphics system

• sug: figtree

  graphical phylogenetic tree viewer

• sug: seaview

  Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny

Stiahnuť bali-phy

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	3.6.1+dfsg-2+b1	6,091.7 kB	39,083.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	3.6.1+dfsg-2+b1	6,382.7 kB	37,532.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	3.6.1+dfsg-2+b1	5,733.5 kB	35,384.0 kB	[zoznam súborov]
armel	3.6.1+dfsg-2+b1	4,895.0 kB	31,410.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	3.6.1+dfsg-2+b1	4,485.1 kB	23,018.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	3.6.1+dfsg-2	6,090.5 kB	36,336.0 kB	[zoznam súborov]
i386	3.6.1+dfsg-2+b1	6,163.5 kB	36,222.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	3.6.1+dfsg-1	9,006.8 kB	69,870.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	3.6.1+dfsg-2+b1	5,523.4 kB	34,831.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	3.6.1+dfsg-2+b1	5,714.9 kB	43,529.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	3.6.1+dfsg-2+b1	5,936.4 kB	42,892.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	3.6.1+dfsg-2+b1	6,244.1 kB	41,282.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	3.6.1+dfsg-2+b3	6,366.5 kB	30,588.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	3.6.1+dfsg-2+b1	5,010.0 kB	35,052.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	3.6.1+dfsg-2+b1	5,065.6 kB	63,553.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	3.5.0.1+dfsg-1	5,788.7 kB	33,442.0 kB	[zoznam súborov]