Package: bali-phy (3.6.1+dfsg-2 and others)
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- Homepage [www.bali-phy.org]
Similar packages:
inferenza baiesiana di allineamenti e filogenie
BAli-Phy (Bayesian Inference of Alignment and Phylogeny) stima allineamenti multipli di sequenze e alberi evolutivi da sequenze di codoni, amminoacidi o DNA non allineato. BAli-Phy usa MCMC per stimare alberi evolutivi, selezione positiva e lunghezze dei rami mentre fa la media su allineamenti alternativi. BAli-Phy può visualizzare graficamente l'ambiguità degli allineamenti in un diagramma AU (alignment uncertainty).
BAli-Phy può anche stimare filogenie da un allineamento fisso (come MrBayes e BEAST) usando modelli di sostituzione come GTR+gamma. BAli-Phy stima automaticamente tassi relativi per ciascun gene.
Other Packages Related to bali-phy
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- dep: libboost-chrono1.71.0 [x32]
- Package not available
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- dep: libboost-chrono1.74.0 (>= 1.74.0) [ia64]
- rappresentazione C++ di intervalli temporali, punti temporali e orologi
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- dep: libboost-chrono1.83.0t64 (>= 1.83.0) [not ia64, x32]
- rappresentazione C++ di intervalli temporali, punti temporali e orologi
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- dep: libboost-filesystem1.71.0 [x32]
- Package not available
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- dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0) [ia64]
- operazioni su filesystem (percorsi portabili, iterazione su directory, ecc.) in C++
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- dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0) [not ia64, x32]
- operazioni su filesystem (percorsi portabili, iterazione su directory, ecc.) in C++
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- dep: libboost-program-options1.71.0 [x32]
- Package not available
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- dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0) [ia64]
- libreria per opzioni di programma per C++
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- dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0) [not ia64, x32]
- libreria per opzioni di programma per C++
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- dep: libboost-random1.71.0 [x32]
- Package not available
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- dep: libboost-random1.74.0 (>= 1.74.0) [ia64]
- libreria Boost per numeri casuali
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- dep: libboost-random1.83.0 (>= 1.83.0) [not ia64, x32]
- libreria Boost per numeri casuali
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- dep: libc6 (>= 2.29) [x32]
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, x32]
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- dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
-
- dep: libcairo2 (>= 1.4.10)
- libreria Cairo per grafica 2D vettoriale
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ppc64el, s390x]
- libreria di supporto a GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, ppc64, sparc64, x32]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- libreria di supporto a GCC
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- libreria di supporto a GCC
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [not alpha, ia64, x32]
- libreria GNU Standard C++, versione 3
- dep: libstdc++6 (>= 14-20240221-2.1) [alpha]
- dep: libstdc++6 (>= 9) [ia64, x32]
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- libreria per tracciare la catena di chiamate di un programma - runtime
-
- dep: perl
- "Practical Extraction and Report Language" di Larry Wall
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- dep: python3
- linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)
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- rec: gnuplot
- programma a riga di comando interattivo per tracciare grafici
also a virtual package provided by gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
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- rec: r-base
- sistema per calcoli e grafici statistici GNU R
Download bali-phy
Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
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alpha (unofficial port) | 3.6.1+dfsg-2+b1 | 6,091.7 kB | 39,083.0 kB | [list of files] |
amd64 | 3.6.1+dfsg-2+b1 | 6,382.7 kB | 37,532.0 kB | [list of files] |
arm64 | 3.6.1+dfsg-2+b1 | 5,733.5 kB | 35,384.0 kB | [list of files] |
armel | 3.6.1+dfsg-2+b1 | 4,895.0 kB | 31,410.0 kB | [list of files] |
armhf | 3.6.1+dfsg-2+b1 | 4,485.1 kB | 23,018.0 kB | [list of files] |
hppa (unofficial port) | 3.6.1+dfsg-2 | 6,090.5 kB | 36,336.0 kB | [list of files] |
i386 | 3.6.1+dfsg-2+b1 | 6,163.5 kB | 36,222.0 kB | [list of files] |
ia64 (unofficial port) | 3.6.1+dfsg-1 | 9,006.8 kB | 69,870.0 kB | [list of files] |
m68k (unofficial port) | 3.6.1+dfsg-2+b1 | 5,523.4 kB | 34,831.0 kB | [list of files] |
mips64el | 3.6.1+dfsg-2+b1 | 5,714.9 kB | 43,529.0 kB | [list of files] |
ppc64 (unofficial port) | 3.6.1+dfsg-2+b1 | 5,936.4 kB | 42,892.0 kB | [list of files] |
ppc64el | 3.6.1+dfsg-2+b1 | 6,244.1 kB | 41,282.0 kB | [list of files] |
riscv64 | 3.6.1+dfsg-2+b3 | 6,366.5 kB | 30,588.0 kB | [list of files] |
s390x | 3.6.1+dfsg-2+b1 | 5,010.0 kB | 35,052.0 kB | [list of files] |
sparc64 (unofficial port) | 3.6.1+dfsg-2+b1 | 5,065.6 kB | 63,553.0 kB | [list of files] |
x32 (unofficial port) | 3.5.0.1+dfsg-1 | 5,788.7 kB | 33,442.0 kB | [list of files] |