套件：bali-phy（3.6.1+dfsg-2 以及其他的）

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外部的資源：

主頁 [www.bali-phy.org]

相似套件：

Bayesian Inference of Alignment and Phylogeny

BAli-Phy estimates multiple sequence alignments and evolutionary trees from unaligned DNA, amino acid, or codon sequences. BAli-Phy uses MCMC to estimate evolutionary trees, positive selection, and branch lengths while averaging over alternative alignments. BAli-Phy can display alignment ambiguity graphically in an alignment uncertainty (AU) plot.

BAli-Phy can also estimate phylogenies from a fixed alignment (like MrBayes and BEAST) using substitution models like GTR+gamma. BAli-Phy automatically estimates relative rates for each gene.

其他與 bali-phy 有關的套件

依賴

推薦

建議

增強

dep: libboost-chrono1.71.0 [x32]

套件暫時不可用
dep: libboost-chrono1.74.0 (>= 1.74.0) [ia64]

C++ representation of time duration, time point, and clocks
dep: libboost-chrono1.83.0t64 (>= 1.83.0) [除 ia64, x32]

C++ representation of time duration, time point, and clocks
dep: libboost-filesystem1.71.0 [x32]

套件暫時不可用
dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0) [ia64]

filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++
dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0) [除 ia64, x32]

filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++
dep: libboost-program-options1.71.0 [x32]

套件暫時不可用
dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0) [ia64]

program options library for C++
dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0) [除 ia64, x32]

program options library for C++
dep: libboost-random1.71.0 [x32]

套件暫時不可用
dep: libboost-random1.74.0 (>= 1.74.0) [ia64]

Boost Random Number Library
dep: libboost-random1.83.0 (>= 1.83.0) [除 ia64, x32]

Boost Random Number Library
dep: libc6 (>= 2.29) [x32]

GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, ia64, x32]
dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
dep: libcairo2 (>= 1.4.10)

Cairo 2D vector graphics library
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ppc64el, s390x]

GCC 支援函式庫

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, ppc64, sparc64, x32]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64]

dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC 支援函式庫
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC 支援函式庫
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [除 alpha, ia64, x32]

GNU Standard C++ Library v3

dep: libstdc++6 (>= 14-20240221-2.1) [alpha]

dep: libstdc++6 (>= 9) [ia64, x32]
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime
dep: perl

Larry Wall's Practical Extraction and Report Language
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

rec: gnuplot

Command-line driven interactive plotting program.
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
rec: r-base

GNU R statistical computation and graphics system

sug: figtree

graphical phylogenetic tree viewer
sug: seaview

Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny

下載 bali-phy

下載可用於所有硬體架構的
硬體架構	版本	套件大小	安裝後大小	檔案
alpha （非官方移植版）	3.6.1+dfsg-2+b1	6，091。7 kB	39，083。0 kB	[檔案列表]
amd64	3.6.1+dfsg-2+b1	6，382。7 kB	37，532。0 kB	[檔案列表]
arm64	3.6.1+dfsg-2+b1	5，733。5 kB	35，384。0 kB	[檔案列表]
armel	3.6.1+dfsg-2+b1	4，895。0 kB	31，410。0 kB	[檔案列表]
armhf	3.6.1+dfsg-2+b1	4，485。1 kB	23，018。0 kB	[檔案列表]
hppa （非官方移植版）	3.6.1+dfsg-2	6，090。5 kB	36，336。0 kB	[檔案列表]
i386	3.6.1+dfsg-2+b1	6，163。5 kB	36，222。0 kB	[檔案列表]
ia64 （非官方移植版）	3.6.1+dfsg-1	9，006。8 kB	69，870。0 kB	[檔案列表]
m68k （非官方移植版）	3.6.1+dfsg-2+b1	5，523。4 kB	34，831。0 kB	[檔案列表]
mips64el	3.6.1+dfsg-2+b1	5，714。9 kB	43，529。0 kB	[檔案列表]
ppc64 （非官方移植版）	3.6.1+dfsg-2+b1	5，936。4 kB	42，892。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	3.6.1+dfsg-2+b1	6，244。1 kB	41，282。0 kB	[檔案列表]
riscv64	3.6.1+dfsg-2+b3	6，366。5 kB	30，588。0 kB	[檔案列表]
s390x	3.6.1+dfsg-2+b1	5，010。0 kB	35，052。0 kB	[檔案列表]
sparc64 （非官方移植版）	3.6.1+dfsg-2+b1	5，065。6 kB	63，553。0 kB	[檔案列表]
x32 （非官方移植版）	3.5.0.1+dfsg-1	5，788。7 kB	33，442。0 kB	[檔案列表]