Balík: bali-phy (4.0~beta16+dfsg-1 a iné)

[ Zdroj: bali-phy  ]

Experimentálny balík

Upozornenie: Tento balík pochádza z distribúcie experimental. To znamená, že je pravdepodobne nestabilný alebo môže dokonca spôsobiť stratu údajov. Predtým, než ho začnete používať sa prosím pozrite do záznamu zmien a ďalšej možnej dokumentácie.

Bayesian Inference of Alignment and Phylogeny

BAli-Phy estimates multiple sequence alignments and evolutionary trees from unaligned DNA, amino acid, or codon sequences. BAli-Phy uses MCMC to estimate evolutionary trees, positive selection, and branch lengths while averaging over alternative alignments. BAli-Phy can display alignment ambiguity graphically in an alignment uncertainty (AU) plot.

BAli-Phy can also estimate phylogenies from a fixed alignment (like MrBayes and BEAST) using substitution models like GTR+gamma. BAli-Phy automatically estimates relative rates for each gene.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom bali-phy

• dep: libboost-chrono1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [armhf, ia64]

  reprezentácia doby trvania, časového bodu a hodín v C++

• dep: libboost-chrono1.83.0t64 (>= 1.83.0) [nie armhf, ia64]

  reprezentácia doby trvania, časového bodu a hodín v C++

• dep: libboost-json1.83.0 (>= 1.83.0) [nie armhf, ia64]

  C++ containers and algorithms that implement JSON

• dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [armhf, ia64]

  knižnica volieb programu pre C++

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0) [nie armhf, ia64]

  knižnica volieb programu pre C++

• dep: libboost-random1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [armhf, ia64]

  knižnica Boost náhodných čísel

• dep: libboost-random1.83.0 (>= 1.83.0) [nie armhf, ia64]

  knižnica Boost náhodných čísel

• dep: libc6 (>= 2.34) [armhf]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [nie armhf, ia64]

• dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

• dep: libcairo2 (>= 1.4.10)

  2D vektorová grafická knižnica Cairo

• dep: libfmt10 (>= 10.1.1+ds1) [nie armhf, ia64]

  fast type-safe C++ formatting library -- library

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [s390x]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  podporná knižnica GCC

• dep: libstdc++6 (>= 11) [armhf, ia64]

  štandardná knižnica C++ GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [m68k]

  dep: libstdc++6 (>= 14) [nie armhf, ia64, m68k]

• dep: libunwind8 [ia64]

  nnižnica na určenie na určenie postupnosti volania programu - dynamické súbory

• dep: perl

  Practical Extraction and Report Language od Larryho Walla

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• rec: gnuplot

  program na interaktívne kreslenie riadený z príkazového riadka
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11

• rec: r-base

  GNU R statistical computation and graphics system

• sug: figtree

  graphical phylogenetic tree viewer

• sug: seaview

  Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny

Stiahnuť bali-phy

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	4.0~beta16+dfsg-1	9,700.1 kB	52,351.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	4.0~beta16+dfsg-1	8,619.4 kB	47,527.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	4.0~beta2+dfsg-1	5,779.1 kB	26,400.0 kB	[zoznam súborov]
i386	4.0~beta16+dfsg-1	9,147.2 kB	50,652.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	4.0~beta2+dfsg-1	11,619.3 kB	82,739.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	4.0~beta16+dfsg-1	7,741.1 kB	44,869.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	4.0~beta16+dfsg-1	8,687.3 kB	57,950.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	4.0~beta16+dfsg-1	9,475.9 kB	55,642.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	4.0~beta16+dfsg-1	10,037.2 kB	41,016.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	4.0~beta16+dfsg-1	7,449.4 kB	47,780.0 kB	[zoznam súborov]