パッケージ: python3-cyvcf2 (0.32.0-1)

[ ソース: cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

その他の python3-cyvcf2 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: python3

  対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (デフォルト python3 バージョン)

  dep: python3 (<< 3.15)

  dep: python3 (>= 3.13~)

• dep: python3-click

  Command-Line Interface Creation Kit - Python 3.x

• dep: python3-coloredlogs

  colored terminal output for Python 3's logging module

• dep: python3-numpy

  Python library for numerical computations (Python 3)

• dep: python3-numpy2-abi0

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: python3-numpy

  または python3-numpy-abi9

  パッケージは利用できません

python3-cyvcf2 のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	1,028.0 kB	6,309.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	968.6 kB	6,263.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	988.1 kB	5,795.0 kB	[ファイル一覧]
i386	995.7 kB	6,379.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	999.8 kB	6,583.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	1,021.7 kB	5,945.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1,012.1 kB	6,303.0 kB	[ファイル一覧]