Pacote: python3-cyvcf2 (0.32.0-1)

[ Fonte: cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Outros pacotes relacionados a python3-cyvcf2

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: python3

  linguagem orientada a objetos de alto nível e interativa (versão python3 padrão)

  dep: python3 (<< 3.15)

  dep: python3 (>= 3.13~)

• dep: python3-click

  Command-Line Interface Creation Kit - Python 3.x

• dep: python3-coloredlogs

  colored terminal output for Python 3's logging module

• dep: python3-numpy

  Python library for numerical computations (Python 3)

• dep: python3-numpy2-abi0

  pacote virtual fornecido por python3-numpy

  ou python3-numpy-abi9

  Pacote não disponível

Download de python3-cyvcf2

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	1,028.0 kB	6,309.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	968.6 kB	6,263.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	988.1 kB	5,795.0 kB	[lista de arquivos]
i386	995.7 kB	6,379.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	999.8 kB	6,583.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	1,021.7 kB	5,945.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	1,012.1 kB	6,303.0 kB	[lista de arquivos]