パッケージ: python3-cyvcf2 (0.32.0-1 など)

[ ソース: cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

その他の python3-cyvcf2 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.38) [alpha, ia64, loong64, sh4 以外]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.42) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: python3

  対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (デフォルト python3 バージョン)

  dep: python3 (<< 3.13) [ia64]

  dep: python3 (<< 3.14) [x32]

  dep: python3 (<< 3.15) [ia64, x32 以外]

  dep: python3 (>= 3.11~) [ia64]

  dep: python3 (>= 3.13~) [ia64 以外]

• dep: python3-click

  Command-Line Interface Creation Kit - Python 3.x

• dep: python3-coloredlogs

  colored terminal output for Python 3's logging module

• dep: python3-numpy [ia64 以外]

  Python library for numerical computations (Python 3)

  dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [ia64]

• dep: python3-numpy-abi9 [ia64]

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: python3-numpy

• dep: python3-numpy2-abi0 [ia64 以外]

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: python3-numpy

  または python3-numpy-abi9

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: python3-numpy

python3-cyvcf2 のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	0.32.0-1	981.5 kB	6,527.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	0.32.0-1	1,028.0 kB	6,309.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	0.32.0-1	968.6 kB	6,263.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	0.32.0-1	988.1 kB	5,795.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	0.32.0-1	962.3 kB	6,763.0 kB	[ファイル一覧]
i386	0.32.0-1	995.7 kB	6,379.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	0.30.28-1+b1	1,027.9 kB	6,797.0 kB	[ファイル一覧]
loong64	0.32.0-1	1,001.9 kB	6,453.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	0.32.0-1	605.7 kB	5,107.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	0.32.0-1	994.2 kB	6,711.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	0.32.0-1	999.8 kB	6,583.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	0.32.0-1	1,021.7 kB	5,945.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	0.32.0-1	1,012.1 kB	6,303.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	0.32.0-1	751.1 kB	5,061.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	0.32.0-1	936.9 kB	6,853.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	0.31.4-1	876.1 kB	5,422.0 kB	[ファイル一覧]