Пакет: python3-cyvcf2 (0.32.0-1)

[ Источник: cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Другие пакеты, относящиеся к python3-cyvcf2

• dep: libc6 (>= 2.38)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: python3

  интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)

  dep: python3 (<< 3.15)

  dep: python3 (>= 3.13~)

• dep: python3-click

  Command-Line Interface Creation Kit - Python 3.x

• dep: python3-coloredlogs

  colored terminal output for Python 3's logging module

• dep: python3-numpy

  Python library for numerical computations (Python 3)

• dep: python3-numpy2-abi0

  виртуальный пакет, предоставляемый python3-numpy

  или python3-numpy-abi9

  Пакет недоступен

Загрузка python3-cyvcf2

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	1 028,0 Кб	6 309,0 Кб	[список файлов]
arm64	968,6 Кб	6 263,0 Кб	[список файлов]
armhf	988,1 Кб	5 795,0 Кб	[список файлов]
i386	995,7 Кб	6 379,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	999,8 Кб	6 583,0 Кб	[список файлов]
riscv64	1 021,7 Кб	5 945,0 Кб	[список файлов]
s390x	1 012,1 Кб	6 303,0 Кб	[список файлов]