Paket: python3-cyvcf2 (0.32.0-1)

[ Quellcode: cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Andere Pakete mit Bezug zu python3-cyvcf2

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  oder python3-numpy-abi9

  Paket nicht verfügbar

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	1.028,0 kB	6.309,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	968,6 kB	6.263,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	988,1 kB	5.795,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	995,7 kB	6.379,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	999,8 kB	6.583,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	1.021,7 kB	5.945,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	1.012,1 kB	6.303,0 kB	[Liste der Dateien]