Paketti: python3-cyvcf2 (0.32.0-1)

[ Source: cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Muut pakettiin python3-cyvcf2 liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.15)

  dep: python3 (>= 3.13~)

• dep: python3-click

  Command-Line Interface Creation Kit - Python 3.x

• dep: python3-coloredlogs

  colored terminal output for Python 3's logging module

• dep: python3-numpy

  Python library for numerical computations (Python 3)

• dep: python3-numpy2-abi0

  näennäispaketti, jonka toteuttaa python3-numpy

  tai python3-numpy-abi9

  Paketti ei saatavilla

Imuroi python3-cyvcf2

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	1,028.0 kt	6,309.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	968.6 kt	6,263.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	988.1 kt	5,795.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	995.7 kt	6,379.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	999.8 kt	6,583.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	1,021.7 kt	5,945.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	1,012.1 kt	6,303.0 kt	[tiedostoluettelo]