Paquet : python3-cyvcf2 (0.32.0-1)

[ Paquet source : cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Autres paquets associés à python3-cyvcf2

• dep: libc6 (>= 2.38)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

  dep: python3 (<< 3.15)

  dep: python3 (>= 3.13~)

• dep: python3-click

  kit de création d’interface en ligne de commande – Python 3.x

• dep: python3-coloredlogs

  sortie colorée de terminal pour le module de connexion de Python 3

• dep: python3-numpy

  bibliothèque de Python pour des calculs numériques – Python 3

• dep: python3-numpy2-abi0

  paquet virtuel fourni par python3-numpy

  ou python3-numpy-abi9

  Paquet indisponible

Télécharger python3-cyvcf2

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	1 028,0 ko	6 309,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	968,6 ko	6 263,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	988,1 ko	5 795,0 ko	[liste des fichiers]
i386	995,7 ko	6 379,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	999,8 ko	6 583,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1 021,7 ko	5 945,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1 012,1 ko	6 303,0 ko	[liste des fichiers]