Paquet : python3-cyvcf2 (0.32.0-1 et autres)

[ Paquet source : cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Autres paquets associés à python3-cyvcf2

• dep: libc6 (>= 2.38) [non alpha, ia64, loong64, sh4]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.42) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

  dep: python3 (<< 3.13) [ia64]

  dep: python3 (<< 3.14) [x32]

  dep: python3 (<< 3.15) [non ia64, x32]

  dep: python3 (>= 3.11~) [ia64]

  dep: python3 (>= 3.13~) [non ia64]

• dep: python3-click

  kit de création d’interface en ligne de commande – Python 3.x

• dep: python3-coloredlogs

  sortie colorée de terminal pour le module de connexion de Python 3

• dep: python3-numpy [non ia64]

  bibliothèque de Python pour des calculs numériques – Python 3

  dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [ia64]

• dep: python3-numpy-abi9 [ia64]

  paquet virtuel fourni par python3-numpy

• dep: python3-numpy2-abi0 [non ia64]

  paquet virtuel fourni par python3-numpy

  ou python3-numpy-abi9

  paquet virtuel fourni par python3-numpy

Télécharger python3-cyvcf2

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	0.32.0-1	981,5 ko	6 527,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	0.32.0-1	1 028,0 ko	6 309,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	0.32.0-1	968,6 ko	6 263,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	0.32.0-1	988,1 ko	5 795,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	0.32.0-1	962,3 ko	6 763,0 ko	[liste des fichiers]
i386	0.32.0-1	995,7 ko	6 379,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	0.30.28-1+b1	1 027,9 ko	6 797,0 ko	[liste des fichiers]
loong64	0.32.0-1	1 001,9 ko	6 453,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	0.32.0-1	605,7 ko	5 107,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	0.32.0-1	994,2 ko	6 711,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	0.32.0-1	999,8 ko	6 583,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	0.32.0-1	1 021,7 ko	5 945,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	0.32.0-1	1 012,1 ko	6 303,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	0.32.0-1	751,1 ko	5 061,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	0.32.0-1	936,9 ko	6 853,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	0.31.4-1	876,1 ko	5 422,0 ko	[liste des fichiers]