Paket: python3-cyvcf2 (0.32.0-1 och andra)

[ Källkod: cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Andra paket besläktade med python3-cyvcf2

• dep: libc6 (>= 2.38) [ej alpha, ia64, loong64, sh4]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.42) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.13) [ia64]

  dep: python3 (<< 3.14) [x32]

  dep: python3 (<< 3.15) [ej ia64, x32]

  dep: python3 (>= 3.11~) [ia64]

  dep: python3 (>= 3.13~) [ej ia64]

• dep: python3-click

  Command-Line Interface Creation Kit - Python 3.x

• dep: python3-coloredlogs

  colored terminal output for Python 3's logging module

• dep: python3-numpy [ej ia64]

  Python library for numerical computations (Python 3)

  dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [ia64]

• dep: python3-numpy-abi9 [ia64]

  virtuellt paket som tillhandahålls av python3-numpy

• dep: python3-numpy2-abi0 [ej ia64]

  virtuellt paket som tillhandahålls av python3-numpy

  eller python3-numpy-abi9

  virtuellt paket som tillhandahålls av python3-numpy

Hämta python3-cyvcf2

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	0.32.0-1	981,5 kbyte	6.527,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	0.32.0-1	1.028,0 kbyte	6.309,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	0.32.0-1	968,6 kbyte	6.263,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	0.32.0-1	988,1 kbyte	5.795,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	0.32.0-1	962,3 kbyte	6.763,0 kbyte	[filförteckning]
i386	0.32.0-1	995,7 kbyte	6.379,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	0.30.28-1+b1	1.027,9 kbyte	6.797,0 kbyte	[filförteckning]
loong64	0.32.0-1	1.001,9 kbyte	6.453,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	0.32.0-1	605,7 kbyte	5.107,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	0.32.0-1	994,2 kbyte	6.711,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	0.32.0-1	999,8 kbyte	6.583,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	0.32.0-1	1.021,7 kbyte	5.945,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	0.32.0-1	1.012,1 kbyte	6.303,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	0.32.0-1	751,1 kbyte	5.061,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	0.32.0-1	936,9 kbyte	6.853,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	0.31.4-1	876,1 kbyte	5.422,0 kbyte	[filförteckning]