Paketti: python3-cyvcf2 (0.32.0-1 ja muut)

[ Source: cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Muut pakettiin python3-cyvcf2 liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.38) [ei alpha, ia64, loong64, sh4]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.42) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.13) [ia64]

  dep: python3 (<< 3.14) [x32]

  dep: python3 (<< 3.15) [ei ia64, x32]

  dep: python3 (>= 3.11~) [ia64]

  dep: python3 (>= 3.13~) [ei ia64]

• dep: python3-click

  Command-Line Interface Creation Kit - Python 3.x

• dep: python3-coloredlogs

  colored terminal output for Python 3's logging module

• dep: python3-numpy [ei ia64]

  Python library for numerical computations (Python 3)

  dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [ia64]

• dep: python3-numpy-abi9 [ia64]

  näennäispaketti, jonka toteuttaa python3-numpy

• dep: python3-numpy2-abi0 [ei ia64]

  näennäispaketti, jonka toteuttaa python3-numpy

  tai python3-numpy-abi9

  näennäispaketti, jonka toteuttaa python3-numpy

Imuroi python3-cyvcf2

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	0.32.0-1	981.5 kt	6,527.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	0.32.0-1	1,028.0 kt	6,309.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	0.32.0-1	968.6 kt	6,263.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	0.32.0-1	988.1 kt	5,795.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	0.32.0-1	962.3 kt	6,763.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	0.32.0-1	995.7 kt	6,379.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	0.30.28-1+b1	1,027.9 kt	6,797.0 kt	[tiedostoluettelo]
loong64	0.32.0-1	1,001.9 kt	6,453.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	0.32.0-1	605.7 kt	5,107.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	0.32.0-1	994.2 kt	6,711.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	0.32.0-1	999.8 kt	6,583.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	0.32.0-1	1,021.7 kt	5,945.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	0.32.0-1	1,012.1 kt	6,303.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	0.32.0-1	751.1 kt	5,061.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	0.32.0-1	936.9 kt	6,853.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	0.31.4-1	876.1 kt	5,422.0 kt	[tiedostoluettelo]