Paket: python3-cyvcf2 (0.32.0-1 und andere)
Links für python3-cyvcf2
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket cyvcf2 herunterladen:
Betreuer:
- Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
- Steffen Moeller (QS-Seite)
- Liubov Chuprikova (QS-Seite)
- Étienne Mollier (QS-Seite)
Externe Ressourcen:
- Homepage [github.com]
Ähnliche Pakete:
VCF parser based on htslib (Python 3)
This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.
cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.
This package installs the library for Python 3.
Andere Pakete mit Bezug zu python3-cyvcf2
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- dep: libc6 (>= 2.38) [nicht alpha, ia64, loong64, sh4]
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.42) [loong64, sh4]
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- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
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- dep: libhts3t64 (>= 1.17)
- C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate
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- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (<< 3.13) [ia64]
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- dep: python3 (<< 3.15) [nicht ia64, x32]
- dep: python3 (>= 3.11~) [ia64]
- dep: python3 (>= 3.13~) [nicht ia64]
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- dep: python3-click
- Command-Line Interface Creation Kit - Python 3.x
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- dep: python3-coloredlogs
- colored terminal output for Python 3's logging module
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- dep: python3-numpy [nicht ia64]
- Python library for numerical computations (Python 3)
- dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [ia64]
-
- dep: python3-numpy-abi9 [ia64]
- virtuelles Paket, bereitgestellt durch python3-numpy
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- dep: python3-numpy2-abi0 [nicht ia64]
- virtuelles Paket, bereitgestellt durch python3-numpy
- oder python3-numpy-abi9
- virtuelles Paket, bereitgestellt durch python3-numpy
python3-cyvcf2 herunterladen
| Architektur | Version | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
|---|---|---|---|---|
| alpha (inoffizielle Portierung) | 0.32.0-1 | 981,5 kB | 6.527,0 kB | [Liste der Dateien] |
| amd64 | 0.32.0-1 | 1.028,0 kB | 6.309,0 kB | [Liste der Dateien] |
| arm64 | 0.32.0-1 | 968,6 kB | 6.263,0 kB | [Liste der Dateien] |
| armhf | 0.32.0-1 | 988,1 kB | 5.795,0 kB | [Liste der Dateien] |
| hppa (inoffizielle Portierung) | 0.32.0-1 | 962,3 kB | 6.763,0 kB | [Liste der Dateien] |
| i386 | 0.32.0-1 | 995,7 kB | 6.379,0 kB | [Liste der Dateien] |
| ia64 (inoffizielle Portierung) | 0.30.28-1+b1 | 1.027,9 kB | 6.797,0 kB | [Liste der Dateien] |
| loong64 | 0.32.0-1 | 1.001,9 kB | 6.453,0 kB | [Liste der Dateien] |
| m68k (inoffizielle Portierung) | 0.32.0-1 | 605,7 kB | 5.107,0 kB | [Liste der Dateien] |
| ppc64 (inoffizielle Portierung) | 0.32.0-1 | 994,2 kB | 6.711,0 kB | [Liste der Dateien] |
| ppc64el | 0.32.0-1 | 999,8 kB | 6.583,0 kB | [Liste der Dateien] |
| riscv64 | 0.32.0-1 | 1.021,7 kB | 5.945,0 kB | [Liste der Dateien] |
| s390x | 0.32.0-1 | 1.012,1 kB | 6.303,0 kB | [Liste der Dateien] |
| sh4 (inoffizielle Portierung) | 0.32.0-1 | 751,1 kB | 5.061,0 kB | [Liste der Dateien] |
| sparc64 (inoffizielle Portierung) | 0.32.0-1 | 936,9 kB | 6.853,0 kB | [Liste der Dateien] |
| x32 (inoffizielle Portierung) | 0.31.4-1 | 876,1 kB | 5.422,0 kB | [Liste der Dateien] |
