Paket: python3-cyvcf2 (0.32.0-1 und andere)

[ Quellcode: cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Andere Pakete mit Bezug zu python3-cyvcf2

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  dep: libc6 (>= 2.42) [loong64, sh4]

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  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

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  C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

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  virtuelles Paket, bereitgestellt durch python3-numpy

  oder python3-numpy-abi9

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch python3-numpy

python3-cyvcf2 herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	0.32.0-1	981,5 kB	6.527,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	0.32.0-1	1.028,0 kB	6.309,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	0.32.0-1	968,6 kB	6.263,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	0.32.0-1	988,1 kB	5.795,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	0.32.0-1	962,3 kB	6.763,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	0.32.0-1	995,7 kB	6.379,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	0.30.28-1+b1	1.027,9 kB	6.797,0 kB	[Liste der Dateien]
loong64	0.32.0-1	1.001,9 kB	6.453,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	0.32.0-1	605,7 kB	5.107,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	0.32.0-1	994,2 kB	6.711,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	0.32.0-1	999,8 kB	6.583,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	0.32.0-1	1.021,7 kB	5.945,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	0.32.0-1	1.012,1 kB	6.303,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	0.32.0-1	751,1 kB	5.061,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	0.32.0-1	936,9 kB	6.853,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	0.31.4-1	876,1 kB	5.422,0 kB	[Liste der Dateien]