Пакунок: bali-phy (4.0~beta16+dfsg-1 and others)

[ Source: bali-phy  ]

Експериментальний пакунок

Warning: This package is from the experimental distribution. That means it is likely unstable or buggy, and it may even cause data loss. Please be sure to consult the changelog and other possible documentation before using it.

Bayesian Inference of Alignment and Phylogeny

BAli-Phy estimates multiple sequence alignments and evolutionary trees from unaligned DNA, amino acid, or codon sequences. BAli-Phy uses MCMC to estimate evolutionary trees, positive selection, and branch lengths while averaging over alternative alignments. BAli-Phy can display alignment ambiguity graphically in an alignment uncertainty (AU) plot.

BAli-Phy can also estimate phylogenies from a fixed alignment (like MrBayes and BEAST) using substitution models like GTR+gamma. BAli-Phy automatically estimates relative rates for each gene.

Інші пакунки пов'язані з bali-phy

• dep: libboost-chrono1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [armhf, ia64]

  C++ representation of time duration, time point, and clocks

• dep: libboost-chrono1.83.0t64 (>= 1.83.0) [not armhf, ia64]

  C++ representation of time duration, time point, and clocks

• dep: libboost-json1.83.0 (>= 1.83.0) [not armhf, ia64]

  C++ containers and algorithms that implement JSON

• dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [armhf, ia64]

  Бібліотека параметрів програми на Сі++

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0) [not armhf, ia64]

  Бібліотека параметрів програми на Сі++

• dep: libboost-random1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [armhf, ia64]

  Boost Random Number Library

• dep: libboost-random1.83.0 (>= 1.83.0) [not armhf, ia64]

  Boost Random Number Library

• dep: libc6 (>= 2.34) [armhf]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [not armhf, ia64]

• dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

• dep: libcairo2 (>= 1.4.10)

  Cairo 2D — бібліотека векторної графіки

• dep: libfmt10 (>= 10.1.1+ds1) [not armhf, ia64]

  fast type-safe C++ formatting library -- library

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [s390x]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libstdc++6 (>= 11) [armhf, ia64]

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [m68k]

  dep: libstdc++6 (>= 14) [not armhf, ia64, m68k]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: perl

  Мова Практичного Видобування та Побудування Звітів Лари Уолла (Larry Wall)

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• rec: gnuplot

  Command-line driven interactive plotting program.
  also a virtual package provided by gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11

• rec: r-base

  GNU R — система для статистичних обчислень та представлення даних в графічному вигляді

• sug: figtree

  graphical phylogenetic tree viewer

• sug: seaview

  Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny

Завантажити bali-phy

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	4.0~beta16+dfsg-1	9,700.1 kB	52,351.0 kB	[список файлів]
arm64	4.0~beta16+dfsg-1	8,619.4 kB	47,527.0 kB	[список файлів]
armhf	4.0~beta2+dfsg-1	5,779.1 kB	26,400.0 kB	[список файлів]
i386	4.0~beta16+dfsg-1	9,147.2 kB	50,652.0 kB	[список файлів]
ia64 (unofficial port)	4.0~beta2+dfsg-1	11,619.3 kB	82,739.0 kB	[список файлів]
m68k (unofficial port)	4.0~beta16+dfsg-1	7,741.1 kB	44,869.0 kB	[список файлів]
mips64el	4.0~beta16+dfsg-1	8,687.3 kB	57,950.0 kB	[список файлів]
ppc64el	4.0~beta16+dfsg-1	9,475.9 kB	55,642.0 kB	[список файлів]
riscv64	4.0~beta16+dfsg-1	10,037.2 kB	41,016.0 kB	[список файлів]
s390x	4.0~beta16+dfsg-1	7,449.4 kB	47,780.0 kB	[список файлів]