Balík: mapdamage (2.2.3+dfsg-2)

[ Zdroj: mapdamage  ]

tracking and quantifying damage patterns in ancient DNA sequences

MapDamage is a computational framework written in Python and R, which tracks and quantifies DNA damage patterns among ancient DNA sequencing reads generated by Next-Generation Sequencing platforms.

MapDamage is developed at the Centre for GeoGenetics by the Orlando Group.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom mapdamage

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armhf, i386]

• dep: libopenblas-dev

  Optimized BLAS (linear algebra) library (dev, meta)

  alebo libblas-dev

  Basic Linear Algebra Subroutines 3 - statická knižnica

  alebo libatlas-base-dev

  Balík nie je dostupný

  alebo libblas.so

  virtuálny balík poskytovaný balíkom libblas-dev, libopenblas-openmp-dev, libopenblas-pthread-dev, libopenblas-serial-dev

• dep: libopenblas-dev

  Optimized BLAS (linear algebra) library (dev, meta)

  alebo liblapack-dev

  knižnica rutín lineárnej algebry, verzia 3 - statická verzia

  alebo libatlas-base-dev

  Balík nie je dostupný

  alebo liblapack.so

  virtuálny balík poskytovaný balíkom liblapack-dev, libopenblas-openmp-dev, libopenblas-pthread-dev, libopenblas-serial-dev

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.15)

  dep: python3 (>= 3.13~)

• dep: python3-pysam

  interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)

• dep: r-base-core

  jadro GNU R na štatistické výpočty a grafický systém

• dep: r-cran-gam

  Generalized Additive Models for R

• dep: r-cran-ggplot2

  implementácia Gramatiky grafiky

• dep: r-cran-inline

  GNU R package to inline C, C++, Fortran functions from R

• dep: r-cran-rcpp

  balík GNU R na hladkú integráciu R a C++

• dep: r-cran-rcppgsl

  GNU R package for integration with the GNU GSL

• dep: seqtk

  Fast and lightweight tool for processing sequences in the FASTA or FASTQ format

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť mapdamage

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	49.0 kB	242.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	48.7 kB	346.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	48.5 kB	344.0 kB	[zoznam súborov]
i386	48.9 kB	240.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	49.4 kB	346.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	48.7 kB	234.0 kB	[zoznam súborov]