Package: bedtools (2.30.0+dfsg-3)

[ Source: bedtools  ]

Programpakke med redskaber for sammenligning af arvemassefunktioner

BEDTools-redskaber giver mulighed for at adressere gængse arvemasseopgaver såsom at finde funktionsoverlap og beregne dækning. Redskaberne er hovedsagelig baseret på fire meget udbredte filformater: BED, GFF/GTF, VCF og SAM/BAM. Med brug af BEDTools kan du udvikle sofistikerede datakanaler, som besvarer komplicerede forskningsspørgsmål ved at udsende flere BEDTools sammen.

Redskabet groupBy er distribueret i pakken filo.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: Suite, Purpose: use::analysing, use::comparing, Data Conversion, use::filtering, works-with::biological-sequence

Other Packages Related to bedtools

• dep: libbz2-1.0

  højkvalitets bloksorteringsfilpakningsbibliotek - kørselstid

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, s390x]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, mips64el, mipsel, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  Kompressionsbibliotek for XZ-formatet

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download bedtools

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	649.1 kB	2,045.0 kB	[list of files]
arm64	567.0 kB	1,877.0 kB	[list of files]
armel	537.4 kB	1,748.0 kB	[list of files]
armhf	554.1 kB	1,260.0 kB	[list of files]
i386	717.1 kB	2,292.0 kB	[list of files]
mips64el	582.2 kB	2,601.0 kB	[list of files]
mipsel	601.8 kB	2,488.0 kB	[list of files]
ppc64el	666.0 kB	2,517.0 kB	[list of files]
s390x	567.4 kB	2,105.0 kB	[list of files]