Paket: bedtools (2.30.0+dfsg-3)

[ Källkod: bedtools  ]

suite of utilities for comparing genomic features

The BEDTools utilities allow one to address common genomics tasks such as finding feature overlaps and computing coverage. The utilities are largely based on four widely-used file formats: BED, GFF/GTF, VCF, and SAM/BAM. Using BEDTools, one can develop sophisticated pipelines that answer complicated research questions by streaming several BEDTools together.

The groupBy utility is distributed in the filo package.

Märken: Field: Biologi, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: Suite, Purpose: use::analysing, use::comparing, Data Conversion, use::filtering, works-with::biological-sequence

Andra paket besläktade med bedtools

• dep: libbz2-1.0

  high-quality block-sorting file compressor library - runtime

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, s390x]

  GCC stödbibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, mips64el, mipsel, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  XZ-format compression library

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

  Kompressionsbibliotek - körtidspaket

Hämta bedtools

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	649,1 kbyte	2.045,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	567,0 kbyte	1.877,0 kbyte	[filförteckning]
armel	537,4 kbyte	1.748,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	554,1 kbyte	1.260,0 kbyte	[filförteckning]
i386	717,1 kbyte	2.292,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	582,2 kbyte	2.601,0 kbyte	[filförteckning]
mipsel	601,8 kbyte	2.488,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	666,0 kbyte	2.517,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	567,4 kbyte	2.105,0 kbyte	[filförteckning]