Пакет: python3-pairtools (0.3.0-3.2 и други) [debports]

[ Източник:  ]

Framework to process sequencing data from a Hi-C experiment

Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.

Process pair-end sequence alignments and perform the following operations:

  - Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end
    sequences of Hi-C DNA molecules
  - Sort .pairs files for downstream analyses
  - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates
  - Generate extensive statistics of Hi-C datasets
  - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria
  - Restore .sam alignments from Hi-C pairs

Други пакети, свързани с python3-pairtools

• dep: cython3

  C-Extensions for Python 3

• dep: libc6 (>= 2.3.4)

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.12)

  dep: python3 (>= 3.10~)

• dep: python3-click

  Command-Line Interface Creation Kit - Python 3.x

• dep: python3-nose

  Пакетът не е наличен

• dep: python3-numpy (>= 1:1.20.0)

  Python library for numerical computations (Python 3)

• dep: python3-numpy-abi9

  виртуален пакет, предлаган от python3-numpy

Изтегляне на python3-pairtools

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
hppa (неофициална архитектура)	0.3.0-3.2+b2	144,6 кБ	640,0 кБ	[списък на файловете]