Paket: spoa (4.1.5-2 ve diğerleri)

[ Kaynak: spoa  ]

SIMD partial order alignment tool

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

spoa ile İlgili Diğer Paketler

• dep: libc6 (>= 2.38) [alpha, ia64, loong64, sh4 değil]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.42) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, loong64, ppc64, ppc64el, riscv64, x32]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [alpha, i386, s390x, sh4, sparc64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC support library

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC support library

• dep: libspoa7.0.0 (>= 4.1.4) [amd64, ia64]

  SIMD partial order alignment library

  dep: libspoa7.0.0 (>= 4.1.5) [amd64, ia64 değil]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [armhf, hppa, m68k, sh4 değil]

  compression library - runtime

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4) [armhf, hppa, m68k, sh4]

spoa indir

Tüm mevcut mimariler için indir

Mimari	Sürüm	Paket Boyutu	Kurulu Boyut	Dosyalar
alpha (resmi olmayan port)	4.1.5-2	36,0 kB	99,0 kB	[dosya listesi]
amd64	4.1.5-2	36,7 kB	79,0 kB	[dosya listesi]
arm64	4.1.5-2	35,7 kB	99,0 kB	[dosya listesi]
armhf	4.1.5-2	33,6 kB	98,0 kB	[dosya listesi]
hppa (resmi olmayan port)	4.1.5-2	36,8 kB	79,0 kB	[dosya listesi]
i386	4.1.5-2	36,9 kB	78,0 kB	[dosya listesi]
ia64 (resmi olmayan port)	4.1.4-1	41,3 kB	106,0 kB	[dosya listesi]
loong64	4.1.5-2	35,6 kB	99,0 kB	[dosya listesi]
m68k (resmi olmayan port)	4.1.5-2	34,6 kB	74,0 kB	[dosya listesi]
ppc64 (resmi olmayan port)	4.1.5-2	36,3 kB	99,0 kB	[dosya listesi]
ppc64el	4.1.5-2	36,9 kB	99,0 kB	[dosya listesi]
riscv64	4.1.5-2	35,4 kB	67,0 kB	[dosya listesi]
s390x	4.1.5-2	36,3 kB	79,0 kB	[dosya listesi]
sh4 (resmi olmayan port)	4.1.5-2	36,1 kB	98,0 kB	[dosya listesi]
sparc64 (resmi olmayan port)	4.1.5-2	34,4 kB	1.061,0 kB	[dosya listesi]
x32 (resmi olmayan port)	4.1.5-2	36,2 kB	74,0 kB	[dosya listesi]