パッケージ: spoa (4.1.5-2 など)

[ ソース: spoa  ]

SIMD partial order alignment tool

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

その他の spoa 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.38) [alpha, ia64, loong64, sh4 以外]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.42) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, loong64, ppc64, ppc64el, riscv64, x32]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [alpha, i386, s390x, sh4, sparc64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libspoa7.0.0 (>= 4.1.4) [amd64, ia64]

  SIMD partial order alignment library

  dep: libspoa7.0.0 (>= 4.1.5) [amd64, ia64 以外]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [armhf, hppa, m68k, sh4 以外]

  圧縮ライブラリ - ランタイム

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4) [armhf, hppa, m68k, sh4]

spoa のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	4.1.5-2	36.0 kB	99.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	4.1.5-2	36.7 kB	79.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	4.1.5-2	35.7 kB	99.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	4.1.5-2	33.6 kB	98.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	4.1.5-2	36.8 kB	79.0 kB	[ファイル一覧]
i386	4.1.5-2	36.9 kB	78.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	4.1.4-1	41.3 kB	106.0 kB	[ファイル一覧]
loong64	4.1.5-2	35.6 kB	99.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	4.1.5-2	34.6 kB	74.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	4.1.5-2	36.3 kB	99.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	4.1.5-2	36.9 kB	99.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	4.1.5-2	35.4 kB	67.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	4.1.5-2	36.3 kB	79.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	4.1.5-2	36.1 kB	98.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	4.1.5-2	34.4 kB	1,061.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	4.1.5-2	36.2 kB	74.0 kB	[ファイル一覧]