Paket: spoa (4.1.5-2 und andere)

[ Quellcode: spoa  ]

SIMD partial order alignment tool

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

Andere Pakete mit Bezug zu spoa

• dep: libc6 (>= 2.38) [nicht alpha, ia64, loong64, sh4]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.42) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, loong64, ppc64, ppc64el, riscv64, x32]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [alpha, i386, s390x, sh4, sparc64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libspoa7.0.0 (>= 4.1.4) [amd64, ia64]

  SIMD partial order alignment library

  dep: libspoa7.0.0 (>= 4.1.5) [nicht amd64, ia64]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [nicht armhf, hppa, m68k, sh4]

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4) [armhf, hppa, m68k, sh4]

spoa herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	4.1.5-2	36,0 kB	99,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	4.1.5-2	36,7 kB	79,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	4.1.5-2	35,7 kB	99,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	4.1.5-2	33,6 kB	98,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	4.1.5-2	36,8 kB	79,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	4.1.5-2	36,9 kB	78,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	4.1.4-1	41,3 kB	106,0 kB	[Liste der Dateien]
loong64	4.1.5-2	35,6 kB	99,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	4.1.5-2	34,6 kB	74,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	4.1.5-2	36,3 kB	99,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	4.1.5-2	36,9 kB	99,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	4.1.5-2	35,4 kB	67,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	4.1.5-2	36,3 kB	79,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	4.1.5-2	36,1 kB	98,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	4.1.5-2	34,4 kB	1.061,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	4.1.5-2	36,2 kB	74,0 kB	[Liste der Dateien]