Paket: eigensoft (8.0.0+dfsg-2)

[ Kaynak: eigensoft  ]

reduction of population bias for genetic analyses

The EIGENSOFT package combines functionality from the group's population genetics methods (Patterson et al. 2006) and their EIGENSTRAT stratification method (Price et al. 2006). The EIGENSTRAT method uses principal components analysis to explicitly model ancestry differences between cases and controls along continuous axes of variation; the resulting correction is specific to a candidate marker's variation in frequency across ancestral populations, minimizing spurious associations while maximizing power to detect true associations. The EIGENSOFT package has a built-in plotting script and supports multiple file formats and quantitative phenotypes.

eigensoft ile İlgili Diğer Paketler

• dep: libblas3

  Basic Linear Algebra Reference implementations, shared library

  ya da libblas.so.3

  sanal paketi sağlayan libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, sh4 değil]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgsl27 (>= 2.7.1)

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: liblapack3

  Library of linear algebra routines 3 - shared version

  ya da liblapack.so.3

  sanal paketi sağlayan libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: liblapacke (>= 3.11.0) [ia64, s390x, sh4]

  Library of linear algebra routines 3 - C lib shared version

  dep: liblapacke (>= 3.12.0) [ia64, s390x, sh4 değil]

• dep: perl

  Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

• rec: gnuplot

  Command-line driven interactive plotting program.
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11

eigensoft indir

Tüm mevcut mimariler için indir

Mimari	Paket Boyutu	Kurulu Boyut	Dosyalar
alpha (resmi olmayan port)	480,8 kB	4.583,0 kB	[dosya listesi]
amd64	504,3 kB	3.869,0 kB	[dosya listesi]
arm64	463,9 kB	4.385,0 kB	[dosya listesi]
armel	404,3 kB	3.564,0 kB	[dosya listesi]
armhf	392,1 kB	2.732,0 kB	[dosya listesi]
hppa (resmi olmayan port)	424,3 kB	3.598,0 kB	[dosya listesi]
i386	493,9 kB	3.787,0 kB	[dosya listesi]
ia64 (resmi olmayan port)	520,5 kB	7.400,0 kB	[dosya listesi]
m68k (resmi olmayan port)	411,2 kB	3.262,0 kB	[dosya listesi]
mips64el	470,9 kB	4.607,0 kB	[dosya listesi]
ppc64 (resmi olmayan port)	517,4 kB	5.473,0 kB	[dosya listesi]
ppc64el	531,4 kB	5.409,0 kB	[dosya listesi]
riscv64	503,1 kB	3.369,0 kB	[dosya listesi]
s390x	501,9 kB	4.541,0 kB	[dosya listesi]
sh4 (resmi olmayan port)	438,5 kB	3.822,0 kB	[dosya listesi]
sparc64 (resmi olmayan port)	397,2 kB	11.898,0 kB	[dosya listesi]
x32 (resmi olmayan port)	504,6 kB	3.836,0 kB	[dosya listesi]