Paketti: eigensoft (8.0.0+dfsg-2)

[ Source: eigensoft  ]

reduction of population bias for genetic analyses

The EIGENSOFT package combines functionality from the group's population genetics methods (Patterson et al. 2006) and their EIGENSTRAT stratification method (Price et al. 2006). The EIGENSTRAT method uses principal components analysis to explicitly model ancestry differences between cases and controls along continuous axes of variation; the resulting correction is specific to a candidate marker's variation in frequency across ancestral populations, minimizing spurious associations while maximizing power to detect true associations. The EIGENSOFT package has a built-in plotting script and supports multiple file formats and quantitative phenotypes.

Muut pakettiin eigensoft liittyvät paketit

• dep: libblas3

  Basic Linear Algebra Reference implementations, shared library

  tai libblas.so.3

  näennäispaketti, jonka toteuttaa libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.34) [ei alpha, ia64, sh4]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgsl27 (>= 2.7.1)

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: liblapack3

  Library of linear algebra routines 3 - shared version

  tai liblapack.so.3

  näennäispaketti, jonka toteuttaa libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: liblapacke (>= 3.11.0) [ia64, s390x, sh4]

  Library of linear algebra routines 3 - C lib shared version

  dep: liblapacke (>= 3.12.0) [ei ia64, s390x, sh4]

• dep: perl

  Larry Wallin kieli tekstitiedostojen analysointia ja raportointia varten

• rec: gnuplot

  Command-line driven interactive plotting program.
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11

Imuroi eigensoft

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	480.8 kt	4,583.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	504.3 kt	3,869.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	463.9 kt	4,385.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	404.3 kt	3,564.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	392.1 kt	2,732.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	424.3 kt	3,598.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	493.9 kt	3,787.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	520.5 kt	7,400.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	411.2 kt	3,262.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	470.9 kt	4,607.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	517.4 kt	5,473.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	531.4 kt	5,409.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	503.1 kt	3,369.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	501.9 kt	4,541.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	438.5 kt	3,822.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	397.2 kt	11,898.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	504.6 kt	3,836.0 kt	[tiedostoluettelo]