Пакет: spaln (3.0.2+dfsg-2 и другие)

[ Источник: spaln  ]

splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA

Spaln (space-efficient spliced alignment) is a stand-alone program that maps and aligns a set of cDNA or protein sequences onto a whole genomic sequence in a single job. It also performs spliced or ordinary alignment after rapid similarity search against a protein sequence database, if a genomic segment or an amino acid sequence is given as a query.

spaln supports a combination of protein sequence database and a given genomic segment and performs rapid similarity searches and (semi-)global alignments of a set of protein sequence queries against a protein sequence database. Spaln adopts multi-phase heuristics that makes it possible to perform the job on a conventional personal computer.

Другие пакеты, относящиеся к spaln

• dep: libc6 (>= 2.33) [hppa, m68k, sh4, x32]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [riscv64]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [не hppa, ia64, m68k, riscv64, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgsl27 (>= 2.7.1) [не hppa, m68k, sh4, x32]

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libgslcblas0 (>= 2.7.1) [sparc64]

  GNU Scientific Library (GSL) -- blas library package

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: spaln-data

  splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA (data)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)

  библиотека сжатия

Загрузка spaln

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	3.0.2+dfsg-2	527,4 Кб	2 362,0 Кб	[список файлов]
amd64	3.0.2+dfsg-2	550,0 Кб	1 901,0 Кб	[список файлов]
arm64	3.0.2+dfsg-2	492,8 Кб	2 230,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	2.4.7+dfsg-1	330,7 Кб	799,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	3.0.2+dfsg-2	679,9 Кб	3 602,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	2.4.7+dfsg-1	306,2 Кб	811,0 Кб	[список файлов]
mips64el	3.0.2+dfsg-2	529,1 Кб	2 342,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	3.0.2+dfsg-2	555,4 Кб	2 690,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	3.0.2+dfsg-2	561,4 Кб	2 615,0 Кб	[список файлов]
riscv64	3.0.2+dfsg-2	652,4 Кб	3 349,0 Кб	[список файлов]
s390x	3.0.2+dfsg-2	567,8 Кб	2 024,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	2.4.7+dfsg-1	373,7 Кб	713,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	3.0.2+dfsg-2	502,1 Кб	14 483,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	2.4.7+dfsg-1	337,2 Кб	813,0 Кб	[список файлов]