Пакет: spaln (2.4.1+dfsg-3)

[ Источник: spaln  ]

splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA

Spaln (space-efficient spliced alignment) is a stand-alone program that maps and aligns a set of cDNA or protein sequences onto a whole genomic sequence in a single job. It also performs spliced or ordinary alignment after rapid similarity search against a protein sequence database, if a genomic segment or an amino acid sequence is given as a query.

spaln supports a combination of protein sequence database and a given genomic segment and performs rapid similarity searches and (semi-)global alignments of a set of protein sequence queries against a protein sequence database. Spaln adopts multi-phase heuristics that makes it possible to perform the job on a conventional personal computer.

Другие пакеты, относящиеся к spaln

• dep: libc6 (>= 2.29)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [не armel, armhf]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: spaln-data

  splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA (data)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)

  библиотека сжатия

Загрузка spaln

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	345,1 Кб	855,0 Кб	[список файлов]
arm64	311,5 Кб	775,0 Кб	[список файлов]
armel	296,6 Кб	781,0 Кб	[список файлов]
armhf	303,3 Кб	589,0 Кб	[список файлов]
i386	349,5 Кб	881,0 Кб	[список файлов]
mips64el	330,2 Кб	955,0 Кб	[список файлов]
mipsel	323,5 Кб	895,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	360,1 Кб	1 120,0 Кб	[список файлов]
s390x	349,1 Кб	1 003,0 Кб	[список файлов]