Пакет: phybin (0.3-7 и другие)

[ Источник: phybin  ]

binning/clustering newick trees by topology

PhyBin is a simple command line tool that classifies a set of Newick tree files by their topology. The purpose of it is to take a large set of tree files and browse through the most common tree topologies.

It can do simple binning of identical trees or more complex clustering based on an all-to-all Robinson-Foulds distance matrix.

phybin produces output files that characterize the size and contents of each bin or cluster (including generating GraphViz-based visual representations of the tree topologies).

Другие пакеты, относящиеся к phybin

• dep: libatomic1 (>= 4.8) [m68k]

  библиотека для атомарного выполнения кода

• dep: libc6 (>= 2.29) [x32]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [m68k]

  dep: libc6 (>= 2.38) [не alpha, ia64, loong64, m68k, x32]

  dep: libc6 (>= 2.42) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libffi8 (>= 3.4)

  библиотека для связывания программ написанных на разных языках

• dep: libgmp10 (>= 2:6.2.1+dfsg1) [ia64, m68k]

  библиотека для работы с числами произвольной точности

  dep: libgmp10 (>= 2:6.3.0+dfsg) [не ia64, m68k, x32]

• dep: libnuma1 (>= 2.0.11) [не ia64, m68k, x32]

  библиотека управления стратегиями NUMA-систем

Загрузка phybin

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	0.3-7	6 343,4 Кб	62 547,0 Кб	[список файлов]
amd64	0.3-7	3 578,3 Кб	26 553,0 Кб	[список файлов]
arm64	0.3-7	3 567,3 Кб	29 774,0 Кб	[список файлов]
armhf	0.3-7	5 186,6 Кб	33 521,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	0.3-7	5 644,2 Кб	59 856,0 Кб	[список файлов]
i386	0.3-7	5 314,7 Кб	42 376,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	0.3-6	6 913,7 Кб	182 517,0 Кб	[список файлов]
loong64	0.3-7	5 771,0 Кб	53 712,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	0.3-6	3 207,8 Кб	33 307,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	0.3-7	3 439,6 Кб	48 798,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	0.3-7	3 464,4 Кб	40 666,0 Кб	[список файлов]
riscv64	0.3-7	4 687,3 Кб	32 590,0 Кб	[список файлов]
s390x	0.3-7	7 118,5 Кб	55 881,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	0.3-7	4 888,5 Кб	78 127,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	0.3-5+b1	9 291,3 Кб	38 282,0 Кб	[список файлов]