Paket: phybin (0.3-7 und andere)

[ Quellcode: phybin  ]

binning/clustering newick trees by topology

PhyBin is a simple command line tool that classifies a set of Newick tree files by their topology. The purpose of it is to take a large set of tree files and browse through the most common tree topologies.

It can do simple binning of identical trees or more complex clustering based on an all-to-all Robinson-Foulds distance matrix.

phybin produces output files that characterize the size and contents of each bin or cluster (including generating GraphViz-based visual representations of the tree topologies).

Andere Pakete mit Bezug zu phybin

• dep: libatomic1 (>= 4.8) [m68k]

  Hilfsbibliothek, die atomare (__atomic) Built-in-Funktionen zur Verfügung stellt

• dep: libc6 (>= 2.29) [x32]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [m68k]

  dep: libc6 (>= 2.38) [nicht alpha, ia64, loong64, m68k, x32]

  dep: libc6 (>= 2.42) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libffi8 (>= 3.4)

  Fremdes Funktionsinterface, Laufzeitbibliothek

• dep: libgmp10 (>= 2:6.2.1+dfsg1) [ia64, m68k]

  Mehrfachgenaue, arithmetische Bibliothek

  dep: libgmp10 (>= 2:6.3.0+dfsg) [nicht ia64, m68k, x32]

• dep: libnuma1 (>= 2.0.11) [nicht ia64, m68k, x32]

  Bibliothek zur Steuerung von NUMA-Richtlinien

phybin herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	0.3-7	6.343,4 kB	62.547,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	0.3-7	3.578,3 kB	26.553,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	0.3-7	3.567,3 kB	29.774,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	0.3-7	5.186,6 kB	33.521,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	0.3-7	5.644,2 kB	59.856,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	0.3-7	5.314,7 kB	42.376,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	0.3-6	6.913,7 kB	182.517,0 kB	[Liste der Dateien]
loong64	0.3-7	5.771,0 kB	53.712,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	0.3-6	3.207,8 kB	33.307,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	0.3-7	3.439,6 kB	48.798,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	0.3-7	3.464,4 kB	40.666,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	0.3-7	4.687,3 kB	32.590,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	0.3-7	7.118,5 kB	55.881,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	0.3-7	4.888,5 kB	78.127,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	0.3-5+b1	9.291,3 kB	38.282,0 kB	[Liste der Dateien]