Paketti: phybin (0.3-6 ja muut)

[ Source: phybin  ]

binning/clustering newick trees by topology

PhyBin is a simple command line tool that classifies a set of Newick tree files by their topology. The purpose of it is to take a large set of tree files and browse through the most common tree topologies.

It can do simple binning of identical trees or more complex clustering based on an all-to-all Robinson-Foulds distance matrix.

phybin produces output files that characterize the size and contents of each bin or cluster (including generating GraphViz-based visual representations of the tree topologies).

Muut pakettiin phybin liittyvät paketit

• dep: libatomic1 (>= 4.8) [armel, m68k]

  support library providing __atomic built-in functions

• dep: libc6 (>= 2.29) [x32]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [ei ia64, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

• dep: libffi8 (>= 3.4)

  Foreign Function Interface library runtime

• dep: libgmp10 (>= 2:6.2.1+dfsg1) [ei riscv64, x32]

  Multiprecision arithmetic library

  dep: libgmp10 (>= 2:6.3.0+dfsg) [riscv64]

Imuroi phybin

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	0.3-6	1,614.5 kt	11,976.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	0.3-6	4,125.4 kt	30,322.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	0.3-6	4,407.2 kt	28,552.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	0.3-6	4,444.7 kt	28,524.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	0.3-6	4,884.4 kt	57,349.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	0.3-6	4,957.4 kt	37,630.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	0.3-6	6,913.7 kt	182,517.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	0.3-6	3,207.8 kt	33,307.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	0.3-6	5,284.0 kt	58,772.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	0.3-6	3,407.6 kt	45,840.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	0.3-6	3,498.6 kt	38,137.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	0.3-6+b1	4,531.3 kt	31,537.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	0.3-6	7,543.2 kt	53,627.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	0.3-6	4,193.3 kt	74,794.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	0.3-5+b1	9,291.3 kt	38,282.0 kt	[tiedostoluettelo]