パッケージ: python3-biopython (1.83+dfsg1-2 など)

[ ソース: python-biopython  ]

Python3 library for bioinformatics

The Biopython Project is an international association of developers of freely available Python tools for computational molecular biology.

It is a distributed collaborative effort to develop Python3 libraries and applications which address the needs of current and future work in bioinformatics. The source code is made available under the Biopython License, which is extremely liberal and compatible with almost every license in the world. The project works along with the Open Bioinformatics Foundation, who generously provide web and CVS space for the project.

その他の python3-biopython 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.3.4) [hppa]

  dep: libc6 (>= 2.34) [armel, armhf, m68k]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.4) [i386, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

• dep: python3 [hppa 以外]

  対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (デフォルト python3 バージョン)

  dep: python3 (<< 3.13) [hppa, sparc64, x32 以外]

  dep: python3 (<< 3.5) [hppa]

  dep: python3 (<< 3.7) [sparc64]

  dep: python3 (<< 3.9) [x32]

  dep: python3 (>= 3.11~) [hppa, sparc64, x32 以外]

  dep: python3 (>= 3.4~) [hppa]

  dep: python3 (>= 3.5~) [sparc64]

  dep: python3 (>= 3.8~) [x32]

• dep: python3-numpy (>= 1:1.10.0~b1) [sparc64]

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

  dep: python3-numpy (>= 1:1.16.0~rc1) [x32]

  dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [hppa, sparc64, x32 以外]

  dep: python3-numpy (>= 1:1.8.0) [hppa]

• dep: python3-numpy-abi9

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: python3-numpy

• dep: python3-reportlab [hppa, sparc64, x32]

  ReportLab library to create PDF documents using Python3

  dep: python3-reportlab (>= 4.0.4-1~) [hppa, sparc64, x32 以外]

• dep: w3c-sgml-lib [hppa, sparc64, x32 以外]

  w3.org DTD and catalog files

• rec: ncbi-blast+ [hppa, sparc64]

  next generation suite of BLAST sequence search tools

  rec: ncbi-blast+ (>= 2.10.0-3) [x32]

  rec: ncbi-blast+ (>= 2.10.1-3) [hppa, sparc64, x32 以外]

• rec: python-biopython-doc (= 1.65+dfsg-1) [hppa]

  Documentation for the Biopython library

  rec: python-biopython-doc (= 1.70+dfsg-2) [sparc64]

  rec: python-biopython-doc (= 1.78+dfsg-2) [x32]

  rec: python-biopython-doc (= 1.83+dfsg1-1) [alpha, armel, ppc64]

  rec: python-biopython-doc (= 1.83+dfsg1-2) [alpha, armel, hppa, ppc64, sparc64, x32 以外]

• sug: bwa [hppa, sparc64 以外]

  Burrows-Wheeler Aligner

• sug: clustalo

  General-purpose multiple sequence alignment program for proteins

• sug: clustalw

  global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

• sug: dialign

  Segment-based multiple sequence alignment

• sug: dssp

  protein secondary structure assignment based on 3D structure

• sug: emboss

  ヨーロッパ分子生物学オープンソフトウェアスイート

• sug: fasttree

  phylogenetic trees from alignments of nucleotide or protein sequences

• sug: mafft

  Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences

• sug: muscle [hppa, sparc64, x32]

  Multiple alignment program of protein sequences

• sug: muscle3 [hppa, sparc64, x32 以外]

  multiple alignment program of protein sequences

• sug: phylip [hppa 以外]

  package of programs for inferring phylogenies

• sug: phyml

  Phylogenetic estimation using Maximum Likelihood

• sug: prank

  Probabilistic Alignment Kit for DNA, codon and amino-acid sequences

• sug: probcons

  確率的で整合性に基づく多重配列アライメント

• sug: python-mysqldb [hppa, sparc64]

  パッケージは利用できません

• sug: python-reportlab [hppa, sparc64]

  パッケージは利用できません

• sug: python3-matplotlib

  Python based plotting system in a style similar to Matlab (Python 3)

• sug: python3-mmtf [hppa, sparc64 以外]

  binary encoding of biological structures (Python 3)

• sug: python3-mysqldb [hppa, sparc64 以外]

  Python interface to MySQL

• sug: python3-pil

  Python Imaging Library (Python3)

• sug: python3-psycopg2

  Python 3 module for PostgreSQL

• sug: python3-rdflib [hppa 以外]

  Python 3 library containing an RDF triple store and RDF parsers/serializers

  sug: python3-rdflib (>= 4) [hppa]

• sug: python3-renderpm [hppa, sparc64, x32]

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: python3-reportlab

• sug: python3-scipy [hppa 以外]

  scientific tools for Python 3

• sug: python3-tk

  Tkinter - Writing Tk applications with Python 3.x

• sug: raxml

  Randomized Axelerated Maximum Likelihood of phylogenetic trees

• sug: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

• sug: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

• sug: w3-dtd-mathml [x32]

  数式マークアップ言語 V2.0 DTD

• sug: wise [hppa, sparc64 以外]

  DNA 配列とタンパク質配列のような生体高分子の比較

  sug: wise (>= 2.4.1-16) [hppa, sparc64]

python3-biopython のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	1.83+dfsg1-1	1,587.0 kB	12,659.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	1.83+dfsg1-2	1,595.9 kB	11,819.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.83+dfsg1-2	1,582.3 kB	12,591.0 kB	[ファイル一覧]
armel	1.83+dfsg1-1	1,578.1 kB	11,719.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	1.83+dfsg1-2	1,563.2 kB	11,503.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	1.65+dfsg-1	1,119.5 kB	7,788.0 kB	[ファイル一覧]
i386	1.83+dfsg1-2	1,588.5 kB	11,805.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	1.83+dfsg1-2	1,563.7 kB	11,647.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1.83+dfsg1-2	1,574.5 kB	12,677.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	1.83+dfsg1-1	1,610.9 kB	12,655.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.83+dfsg1-2	1,614.8 kB	12,657.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	1.83+dfsg1-2	1,590.8 kB	11,625.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1.83+dfsg1-2	1,610.9 kB	11,845.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	1.83+dfsg1-2	1,626.3 kB	12,503.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	1.70+dfsg-2	1,139.3 kB	8,250.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	1.78+dfsg-2	1,365.8 kB	9,193.0 kB	[ファイル一覧]