パッケージ: clustalw (2.1+lgpl-7 など)

[ ソース: clustalw  ]

global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

This program performs an alignment of multiple nucleotide or amino acid sequences. It recognizes the format of input sequences and whether the sequences are nucleic acid (DNA/RNA) or amino acid (proteins). The output format may be selected from in various formats for multiple alignments such as Phylip or FASTA. Clustal W is very well accepted.

The output of Clustal W can be edited manually but preferably with an alignment editor like SeaView or within its companion Clustal X. When building a model from your alignment, this can be applied for improved database searches. The Debian package hmmer creates such in form of an HMM.

タグ: 生物学: Clustal/ALN, タンパク質, 分野: field::biology, field::biology:bioinformatics, 実装言語: implemented-in::c++, interface::commandline, ユーザインタフェース: テキストベースの対話, 役割: role::program, scope::utility, 目的: 比較, サポート形式: works-with-format::plaintext, works-with::TODO

その他の clustalw 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.29) [alpha, ia64, riscv64, sh4 以外]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [riscv64 以外]

• dep: libunwind8 [ia64]

  プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

• sug: clustalx

  Multiple alignment of nucleic acid and protein sequences (graphical interface)

• sug: seaview

  Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny

• enh: bioperl-run

  BioPerl wrappers: scripts

• enh: emboss

  ヨーロッパ分子生物学オープンソフトウェアスイート

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

clustalw のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	2.1+lgpl-7	276.6 kB	920.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	2.1+lgpl-7	275.1 kB	787.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	2.1+lgpl-7	241.9 kB	710.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	2.1+lgpl-7	259.6 kB	737.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	2.1+lgpl-7	344.9 kB	1,516.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	2.1+lgpl-7	264.7 kB	790.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	2.1+lgpl-7	259.1 kB	941.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	2.1+lgpl-7	276.1 kB	982.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	2.1+lgpl-7	276.5 kB	918.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	2.1+lgpl-7+b1	274.2 kB	622.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	2.1+lgpl-7	247.5 kB	794.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	2.1+lgpl-7	314.8 kB	714.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	2.1+lgpl-7	231.2 kB	747.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	2.1+lgpl-7	275.3 kB	750.0 kB	[ファイル一覧]