Package: mcaller (1.0.3+git20210624.b415090-3)

[ Source: mcaller  ]

trova metilazioni in letture nanopore

   H
   |
 H-C-aller
   |
   H

Questo programma è progettato per identificare m6A da dati nanopore usando le differenze tra le correnti misurate e attese.

Other Packages Related to mcaller

• dep: python3

  linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)

• dep: python3-biopython

  libreria Python 3 per bioinformatica

• dep: python3-h5py

  interfaccia Python di uso generico per hdf5

• dep: python3-matplotlib

  sistema di tracciamento grafici basato su Python in uno stile simile a Matlab (Python 3)

• dep: python3-numpy

  veloce funzionalità per array per il linguaggio Python (Python 3)

• dep: python3-pandas

  strutture dati per dati "relazionali" o "etichettati"

• dep: python3-pysam

  interfaccia al formato SAM/BAM per allineamento e mappatura di sequenze (Python 3)

• dep: python3-scipy

  strumenti scientifici per Python 3

• dep: python3-seaborn

  libreria di visualizzazione statistica per Python3

• dep: python3-sklearn

  moduli Python per l'apprendimento automatico e il data mining - Python 3

• rec: nanopolish

  identificatore di sequenze di consenso per dati di sequenziamento a nanopori

  or poretools

  toolkit per dati Nanopore di sequenziamento di nucleotidi

• sug: bwa

  Burrows-Wheeler Aligner

• sug: graphmap

  Package not available

Download mcaller

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	18.5 kB	83.0 kB	[list of files]