Package: bwa (0.7.17-7 and others)
Links for bwa
Debian Resources:
Download Source Package bwa:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Charles Plessy (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
- Carlos Borroto (QA Page)
- Ognyan Kulev (QA Page)
- Michael R. Crusoe (QA Page)
External Resources:
- Homepage [bio-bwa.sourceforge.net]
Similar packages:
Burrows-Wheeler Aligner
BWA è un pacchetto software per mappare sequenze con bassa divergenza rispetto a vasti genomi di riferimento, come il genoma umano. Consiste di tre algoritmi: BWA-backtrack, BWA-SW e BWA-MEM. Il primo è progettato per sequenze Illumina fino a 100pb, mentre gli altri due per sequenze più lunghe da 70pb a 1Mpb. BWA-MEM e BWA-SH condividono funzionalità simili, come gestione per lunghe sequenze e allineamenti spezzati, ma BWA-MEM, che è il più recente, è generalmente quello raccomandato per interrogazioni di alta qualità perché più veloce e più accurato. BWA-MEM ha prestazioni migliori anche rispetto a BWA-backtrack per sequenze Illumina 70-100pb.
Other Packages Related to bwa
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- dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4]
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- libreria di compressione - runtime
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- rec: perl
- "Practical Extraction and Report Language" di Larry Wall
-
- sug: samtools
- elaborazioni di allineamenti di sequenze nei formati SAM, BAM e CRAM
Download bwa
Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|---|
alpha (unofficial port) | 0.7.17-7+b5 | 206.9 kB | 513.0 kB | [list of files] |
amd64 | 0.7.17-7+b3 | 207.3 kB | 453.0 kB | [list of files] |
arm64 | 0.7.17-7+b3 | 189.1 kB | 449.0 kB | [list of files] |
armel | 0.7.17-7+b3 | 190.8 kB | 432.0 kB | [list of files] |
armhf | 0.7.17-7+b3 | 190.0 kB | 320.0 kB | [list of files] |
hppa (unofficial port) | 0.7.17-7+b3 | 226.4 kB | 513.0 kB | [list of files] |
i386 | 0.7.17-7+b3 | 230.1 kB | 520.0 kB | [list of files] |
ia64 (unofficial port) | 0.7.17-7+b4 | 280.4 kB | 925.0 kB | [list of files] |
m68k (unofficial port) | 0.7.17-7+b3 | 204.7 kB | 472.0 kB | [list of files] |
mips64el | 0.7.17-7+b3 | 201.0 kB | 528.0 kB | [list of files] |
ppc64 (unofficial port) | 0.7.17-7+b3 | 218.1 kB | 577.0 kB | [list of files] |
ppc64el | 0.7.17-7+b3 | 228.6 kB | 577.0 kB | [list of files] |
riscv64 | 0.7.17-7+b3 | 214.5 kB | 376.0 kB | [list of files] |
s390x | 0.7.17-7+b3 | 220.3 kB | 509.0 kB | [list of files] |
sh4 (unofficial port) | 0.7.17-7+b3 | 273.6 kB | 449.0 kB | [list of files] |
sparc64 (unofficial port) | 0.7.17-7+b3 | 182.7 kB | 1,093.0 kB | [list of files] |
x32 (unofficial port) | 0.7.17-7+b3 | 218.9 kB | 468.0 kB | [list of files] |