Paket: spoa (4.1.5-2)

[ Quellcode: spoa  ]

SIMD partial order alignment tool

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

Andere Pakete mit Bezug zu spoa

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armhf, i386, s390x]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, s390x]

• dep: libspoa7.0.0 (>= 4.1.4) [amd64]

  SIMD partial order alignment library

  dep: libspoa7.0.0 (>= 4.1.5) [nicht amd64]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [nicht armhf]

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4) [armhf]

spoa herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	36,7 kB	79,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	35,7 kB	99,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	33,6 kB	98,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	36,9 kB	78,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	36,9 kB	99,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	35,4 kB	67,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	36,3 kB	79,0 kB	[Liste der Dateien]