Пакет: freebayes (1.3.7-1~exp и други)

[ Източник: freebayes  ]

Експериментален пакет

Предупреждение: Този пакет е от дистрибуцията experimental. Това означава, че е възможно да е нестабилен или да има грешки, а може дори и да предизвика загуба на данни. Прочетете информация за промените и останалата документация преди да го използвате.

Bayesian haplotype-based polymorphism discovery and genotyping

FreeBayes is a Bayesian genetic variant detector designed to find small polymorphisms, specifically SNPs (single-nucleotide polymorphisms), indels (insertions and deletions), MNPs (multi-nucleotide polymorphisms), and complex events (composite insertion and substitution events) smaller than the length of a short-read sequencing alignment.

Други пакети, свързани с freebayes

• dep: libc6 (>= 2.34) [не ia64, sh4]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, s390x]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64, ppc64, ppc64el, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC support library

• dep: libseqlib2 (>= 1.2.0) [amd64]

  C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data

  dep: libseqlib2 (>= 1.2.0+dfsg) [не amd64]

• dep: libstdc++6 (>= 11) [armel, armhf, i386, riscv64, s390x, sparc64]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [не armel, armhf, i386, riscv64, s390x, sparc64]

• dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0)

  C++ wrapper to tabix indexer

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: libvcflib1 (>= 1.0.3+dfsg) [не amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]

  C++ library for parsing and manipulating VCF files

  dep: libvcflib1 (>= 1.0.9+dfsg) [riscv64]

• dep: libvcflib2 (>= 1.0.9+dfsg1) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el]

  C++ library for parsing and manipulating VCF files

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  compression library - runtime

• rec: parallel

  build and execute command lines from standard input in parallel

Изтегляне на freebayes

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	1.3.7-1~exp+b1	1 453,0 кБ	4 027,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	1.3.7-1~exp+b1	1 397,1 кБ	3 922,0 кБ	[списък на файловете]
armel	1.3.7-1~exp	1 378,4 кБ	3 821,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	1.3.7-1~exp	1 386,2 кБ	3 445,0 кБ	[списък на файловете]
i386	1.3.7-1~exp	1 502,3 кБ	4 185,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	1.3.7-1~exp+b1	1 573,9 кБ	5 599,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	1.3.7-1~exp+b1	1 404,1 кБ	3 930,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	1.3.7-1~exp+b1	1 428,4 кБ	4 378,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	1.3.7-1~exp+b1	1 455,3 кБ	4 498,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	1.3.7-1~exp+b1	1 473,5 кБ	4 307,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64 (неофициална архитектура)	1.3.7-1~exp	1 435,6 кБ	3 701,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	1.3.7-1~exp	1 375,9 кБ	4 052,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	1.3.7-1~exp+b1	1 533,1 кБ	3 916,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	1.3.7-1~exp	1 357,1 кБ	4 639,0 кБ	[списък на файловете]