Пакет: freebayes (1.3.7-1 и други)

[ Източник: freebayes  ]

Bayesian haplotype-based polymorphism discovery and genotyping

FreeBayes is a Bayesian genetic variant detector designed to find small polymorphisms, specifically SNPs (single-nucleotide polymorphisms), indels (insertions and deletions), MNPs (multi-nucleotide polymorphisms), and complex events (composite insertion and substitution events) smaller than the length of a short-read sequencing alignment.

Други пакети, свързани с freebayes

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, sh4]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, ppc64, ppc64el, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC support library

• dep: libseqlib2 (>= 1.2.0) [amd64]

  C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data

  dep: libseqlib2 (>= 1.2.0+dfsg) [не amd64]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [не alpha]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 13.2.0-2) [alpha]

• dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0)

  C++ wrapper to tabix indexer

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: libvcflib1 (>= 1.0.3+dfsg) [ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64]

  C++ library for parsing and manipulating VCF files

• dep: libvcflib2 (>= 1.0.9+dfsg1) [не ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64]

  C++ library for parsing and manipulating VCF files

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  compression library - runtime

• rec: parallel

  build and execute command lines from standard input in parallel

Изтегляне на freebayes

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	1.3.7-1	1 451,7 кБ	4 308,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	1.3.7-1	1 452,7 кБ	4 024,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	1.3.7-1	1 397,0 кБ	3 919,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	1.3.6-2+b1	1 561,5 кБ	5 564,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	1.3.6-2+b1	1 396,9 кБ	3 912,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	1.3.7-1	1 428,4 кБ	4 375,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	1.3.6-2+b1	1 458,5 кБ	4 480,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	1.3.7-1	1 473,4 кБ	4 304,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	1.3.7-1+b1	1 459,7 кБ	3 736,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	1.3.6-2+b1	1 531,0 кБ	3 898,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	1.3.6-2+b1	1 354,8 кБ	4 621,0 кБ	[списък на файловете]