Paketti: freebayes (1.3.7-1~exp ja muut)

[ Source: freebayes  ]

Kokeellinen paketti

Varoitus: Tämä paketti on kokeellisesta jakelusta. Tämä tarkoittaa, että se on luultavasti epävakaa tai buginen, ja voi aiheuttaa jopa tiedonhäviötä. Kannattaa ehdottomasti tutustua muutoslokiin ja muihin mahdollisiin ohjeisiin ennen käyttöönottoa.

Bayesian haplotype-based polymorphism discovery and genotyping

FreeBayes is a Bayesian genetic variant detector designed to find small polymorphisms, specifically SNPs (single-nucleotide polymorphisms), indels (insertions and deletions), MNPs (multi-nucleotide polymorphisms), and complex events (composite insertion and substitution events) smaller than the length of a short-read sequencing alignment.

Muut pakettiin freebayes liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.34) [ei ia64, sh4]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, s390x]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64, ppc64, ppc64el, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libseqlib2 (>= 1.2.0) [amd64]

  C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data

  dep: libseqlib2 (>= 1.2.0+dfsg) [ei amd64]

• dep: libstdc++6 (>= 11) [armel, armhf, i386, riscv64, s390x, sparc64]

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ei armel, armhf, i386, riscv64, s390x, sparc64]

• dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0)

  C++ wrapper to tabix indexer

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: libvcflib1 (>= 1.0.3+dfsg) [ei amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]

  C++ library for parsing and manipulating VCF files

  dep: libvcflib1 (>= 1.0.9+dfsg) [riscv64]

• dep: libvcflib2 (>= 1.0.9+dfsg1) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el]

  C++ library for parsing and manipulating VCF files

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

• rec: parallel

  build and execute command lines from standard input in parallel

Imuroi freebayes

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	1.3.7-1~exp+b1	1,453.0 kt	4,027.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	1.3.7-1~exp+b1	1,397.1 kt	3,922.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	1.3.7-1~exp	1,378.4 kt	3,821.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	1.3.7-1~exp	1,386.2 kt	3,445.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	1.3.7-1~exp	1,502.3 kt	4,185.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	1.3.7-1~exp+b1	1,573.9 kt	5,599.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	1.3.7-1~exp+b1	1,404.1 kt	3,930.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	1.3.7-1~exp+b1	1,428.4 kt	4,378.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	1.3.7-1~exp+b1	1,455.3 kt	4,498.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	1.3.7-1~exp+b1	1,473.5 kt	4,307.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64 (epävirallinen siirros)	1.3.7-1~exp	1,435.6 kt	3,701.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	1.3.7-1~exp	1,375.9 kt	4,052.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	1.3.7-1~exp+b1	1,533.1 kt	3,916.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	1.3.7-1~exp	1,357.1 kt	4,639.0 kt	[tiedostoluettelo]