软件包：concavity（0.1+dfsg.1-5 以及其他的）

[ 源代码： concavity  ]

predictor of protein ligand binding sites from structure and conservation

ConCavity predicts protein ligand binding sites by combining evolutionary sequence conservation and 3D structure.

ConCavity takes as input a PDB format protein structure and optionally files that characterize the evolutionary sequence conservation of the chains in the structure file.

The following result files are produced by default:

 * Residue ligand binding predictions for each chain (*.scores).
 * Residue ligand binding predictions in a PDB format file (residue
   scores placed in the temp. factor field, *_residue.pdb).
 * Pocket prediction locations in a DX format file (*.dx).
 * PyMOL script to visualize the predictions (*.pml).

其他与 concavity 有关的软件包

• dep: libc6 (>= 2.29) [除 alpha, ia64, riscv64, sh4]

  GNU C 语言运行库：共享库
  同时作为一个虚包由这些包填实： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  GNU C 语言运行库：共享库
  同时作为一个虚包由这些包填实： libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [除 armel, armhf, hppa, ia64, m68k, sh4]

  GCC 支持库

  dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 支持库

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 支持库

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  GNU 标准 C++ 库，第3版

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• sug: conservation-code

  protein sequence conservation scoring tool

• sug: pymol

  Molecular Graphics System

下载 concavity

下载可用于所有硬件架构的

硬件架构	版本	软件包大小	安装后大小	文件
alpha （非官方移植版）	0.1+dfsg.1-5	237.3 kB	1,051.0 kB	[文件列表]
amd64	0.1+dfsg.1-5	238.5 kB	973.0 kB	[文件列表]
arm64	0.1+dfsg.1-5	224.0 kB	941.0 kB	[文件列表]
armel	0.1+dfsg.1-5	224.9 kB	933.0 kB	[文件列表]
armhf	0.1+dfsg.1-5	222.9 kB	809.0 kB	[文件列表]
hppa （非官方移植版）	0.1+dfsg.1-5	236.6 kB	981.0 kB	[文件列表]
i386	0.1+dfsg.1-5	252.5 kB	1,020.0 kB	[文件列表]
ia64 （非官方移植版）	0.1+dfsg.1-5	266.8 kB	1,406.0 kB	[文件列表]
m68k （非官方移植版）	0.1+dfsg.1-5	235.2 kB	976.0 kB	[文件列表]
mips64el	0.1+dfsg.1-5	252.7 kB	1,168.0 kB	[文件列表]
ppc64 （非官方移植版）	0.1+dfsg.1-5	252.3 kB	1,194.0 kB	[文件列表]
ppc64el	0.1+dfsg.1-5	252.8 kB	1,130.0 kB	[文件列表]
riscv64	0.1+dfsg.1-5+b1	242.3 kB	885.0 kB	[文件列表]
s390x	0.1+dfsg.1-5	224.1 kB	969.0 kB	[文件列表]
sh4 （非官方移植版）	0.1+dfsg.1-5	273.7 kB	1,001.0 kB	[文件列表]
sparc64 （非官方移植版）	0.1+dfsg.1-5	218.0 kB	971.0 kB	[文件列表]
x32 （非官方移植版）	0.1+dfsg.1-5	238.1 kB	948.0 kB	[文件列表]