Paket: concavity (0.1+dfsg.1-5 och andra)
Länkar för concavity
Debianresurser:
Hämta källkodspaketet concavity:
- [concavity_0.1+dfsg.1-5.dsc]
- [concavity_0.1+dfsg.1.orig.tar.xz]
- [concavity_0.1+dfsg.1-5.debian.tar.xz]
Ansvariga:
Externa resurser:
- Hemsida [compbio.cs.princeton.edu]
Liknande paket:
predictor of protein ligand binding sites from structure and conservation
ConCavity predicts protein ligand binding sites by combining evolutionary sequence conservation and 3D structure.
ConCavity takes as input a PDB format protein structure and optionally files that characterize the evolutionary sequence conservation of the chains in the structure file.
The following result files are produced by default:
* Residue ligand binding predictions for each chain (*.scores). * Residue ligand binding predictions in a PDB format file (residue scores placed in the temp. factor field, *_residue.pdb). * Pocket prediction locations in a DX format file (*.dx). * PyMOL script to visualize the predictions (*.pml).
Andra paket besläktade med concavity
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.29) [ej alpha, ia64, riscv64, sh4]
- GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]
- GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ej armel, armhf, hppa, ia64, m68k, sh4]
- GCC stödbibliotek
- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC stödbibliotek
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- GCC stödbibliotek
-
- dep: libstdc++6 (>= 5)
- GNU standardbibliotek v3 för C++
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- library to determine the call-chain of a program - runtime
-
- sug: conservation-code
- protein sequence conservation scoring tool
-
- sug: pymol
- Molecular Graphics System
Hämta concavity
Arkitektur | Version | Paketstorlek | Installerad storlek | Filer |
---|---|---|---|---|
alpha (inofficiell anpassning) | 0.1+dfsg.1-5 | 237,3 kbyte | 1.051,0 kbyte | [filförteckning] |
amd64 | 0.1+dfsg.1-5 | 238,5 kbyte | 973,0 kbyte | [filförteckning] |
arm64 | 0.1+dfsg.1-5 | 224,0 kbyte | 941,0 kbyte | [filförteckning] |
armel | 0.1+dfsg.1-5 | 224,9 kbyte | 933,0 kbyte | [filförteckning] |
armhf | 0.1+dfsg.1-5 | 222,9 kbyte | 809,0 kbyte | [filförteckning] |
hppa (inofficiell anpassning) | 0.1+dfsg.1-5 | 236,6 kbyte | 981,0 kbyte | [filförteckning] |
i386 | 0.1+dfsg.1-5 | 252,5 kbyte | 1.020,0 kbyte | [filförteckning] |
ia64 (inofficiell anpassning) | 0.1+dfsg.1-5 | 266,8 kbyte | 1.406,0 kbyte | [filförteckning] |
m68k (inofficiell anpassning) | 0.1+dfsg.1-5 | 235,2 kbyte | 976,0 kbyte | [filförteckning] |
mips64el | 0.1+dfsg.1-5 | 252,7 kbyte | 1.168,0 kbyte | [filförteckning] |
ppc64 (inofficiell anpassning) | 0.1+dfsg.1-5 | 252,3 kbyte | 1.194,0 kbyte | [filförteckning] |
ppc64el | 0.1+dfsg.1-5 | 252,8 kbyte | 1.130,0 kbyte | [filförteckning] |
riscv64 | 0.1+dfsg.1-5+b1 | 242,3 kbyte | 885,0 kbyte | [filförteckning] |
s390x | 0.1+dfsg.1-5 | 224,1 kbyte | 969,0 kbyte | [filförteckning] |
sh4 (inofficiell anpassning) | 0.1+dfsg.1-5 | 273,7 kbyte | 1.001,0 kbyte | [filförteckning] |
sparc64 (inofficiell anpassning) | 0.1+dfsg.1-5 | 218,0 kbyte | 971,0 kbyte | [filförteckning] |
x32 (inofficiell anpassning) | 0.1+dfsg.1-5 | 238,1 kbyte | 948,0 kbyte | [filförteckning] |