Paket: bedtools (2.31.1+dfsg-2 ve diğerleri)

[ Kaynak: bedtools  ]

suite of utilities for comparing genomic features

The BEDTools utilities allow one to address common genomics tasks such as finding feature overlaps and computing coverage. The utilities are largely based on four widely-used file formats: BED, GFF/GTF, VCF, and SAM/BAM. Using BEDTools, one can develop sophisticated pipelines that answer complicated research questions by streaming several BEDTools together.

The groupBy utility is distributed in the filo package.

Etiketler: Alan: Biyoloji, Biyoinformatik, Geliştirildiği dil: implemented-in::c++, interface::commandline, Rol: Program, Kapsam: Takım, Amaç: use::analysing, use::comparing, Veri Dönüştürme, use::filtering, works-with::biological-sequence

bedtools ile İlgili Diğer Paketler

• dep: libbz2-1.0 [sparc64 değil]

  high-quality block-sorting file compressor library - runtime

• dep: libc6 (>= 2.23) [sparc64]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, sh4, sparc64 değil]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, s390x, x32]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC support library

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC support library

• dep: libgcc1 (>= 1:3.4) [sparc64]

  Paket mevcut değil

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614) [sparc64 değil]

  XZ-format compression library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [sparc64 değil]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [sparc64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64 değil]

  compression library - runtime

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [sparc64]

bedtools indir

Tüm mevcut mimariler için indir

Mimari	Sürüm	Paket Boyutu	Kurulu Boyut	Dosyalar
alpha (resmi olmayan port)	2.31.1+dfsg-2	608,1 kB	2.458,0 kB	[dosya listesi]
amd64	2.31.1+dfsg-2	661,8 kB	2.106,0 kB	[dosya listesi]
arm64	2.31.1+dfsg-2	574,4 kB	2.006,0 kB	[dosya listesi]
armel	2.31.1+dfsg-2	547,2 kB	1.817,0 kB	[dosya listesi]
armhf	2.31.1+dfsg-2	564,5 kB	1.313,0 kB	[dosya listesi]
hppa (resmi olmayan port)	2.31.1+dfsg-2	621,0 kB	1.976,0 kB	[dosya listesi]
i386	2.31.1+dfsg-2	727,9 kB	2.301,0 kB	[dosya listesi]
ia64 (resmi olmayan port)	2.31.1+dfsg-2	796,8 kB	4.272,0 kB	[dosya listesi]
m68k (resmi olmayan port)	2.31.1+dfsg-2	623,5 kB	2.045,0 kB	[dosya listesi]
mips64el	2.31.1+dfsg-2	582,9 kB	2.599,0 kB	[dosya listesi]
ppc64 (resmi olmayan port)	2.31.1+dfsg-2	658,7 kB	2.710,0 kB	[dosya listesi]
ppc64el	2.31.1+dfsg-2	664,1 kB	2.518,0 kB	[dosya listesi]
riscv64	2.31.1+dfsg-2+b2	644,0 kB	1.603,0 kB	[dosya listesi]
s390x	2.31.1+dfsg-2	646,6 kB	2.162,0 kB	[dosya listesi]
sh4 (resmi olmayan port)	2.31.1+dfsg-2	752,8 kB	1.942,0 kB	[dosya listesi]
sparc64 (resmi olmayan port)	2.26.0+dfsg-5	460,9 kB	1.898,0 kB	[dosya listesi]
x32 (resmi olmayan port)	2.31.1+dfsg-2	665,9 kB	2.001,0 kB	[dosya listesi]