Пакет: nanopolish (0.14.0-1 и други)
Връзки за nanopolish
Ресурси за Debian:
- Доклади за грешки
- Developer Information
- Журнал на промените в Debian
- Авторски права
- Управление на кръпките в Debian
Изтегляне на пакет-източник nanopolish.
Отговорници:
Външни препратки:
- Начална страница [github.com]
Подобни пакети:
consensus caller for nanopore sequencing data
Nanopolish uses a signal-level hidden Markov model for consensus calling of nanopore genome sequencing data. It can perform signal-level analysis of Oxford Nanopore sequencing data. Nanopolish can calculate an improved consensus sequence for a draft genome assembly, detect base modifications, call SNPs and indels with respect to a reference genome and more.
Други пакети, свързани с nanopolish
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.23) [sparc64]
- GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.29) [ppc64]
- dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, ppc64, sh4, sparc64]
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [amd64, arm64, i386, mips64el, x32]
- GCC support library
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, sh4]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC support library
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- GCC support library
-
- dep: libgcc1 (>= 1:3.4) [sparc64]
- Пакетът не е наличен
-
- dep: libgomp1 (>= 4.9) [sparc64]
- GCC OpenMP (GOMP) support library
- dep: libgomp1 (>= 6) [не sparc64]
-
- dep: libhdf5-100 [sparc64]
- Пакетът не е наличен
-
- dep: libhdf5-103-1 [ppc64]
- HDF5 C runtime files - serial version
-
- dep: libhdf5-103-1t64 [не ppc64, sparc64]
- HDF5 C runtime files - serial version
-
- dep: libhts2 [sparc64]
- Пакетът не е наличен
-
- dep: libhts3 (>= 1.10) [ppc64]
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: libhts3t64 (>= 1.17) [не ppc64, sparc64]
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: libslow5-0 (>= 0.5.1) [x32]
- library for reading & writing SLOW5 files
- dep: libslow5-0 (>= 0.5.1+dfsg) [hppa]
-
- dep: libslow5-0t64 (>= 0.5.1) [не hppa, ppc64, sparc64, x32]
- library for reading & writing SLOW5 files
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [не ppc64, sparc64]
- GNU Standard C++ Library v3
- dep: libstdc++6 (>= 5.2) [sparc64]
- dep: libstdc++6 (>= 9) [ppc64]
-
- dep: libstreamvbyte0 (>= 0.4.1) [не ppc64, sparc64]
- fast integer compression in C using the StreamVByte codec
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- library to determine the call-chain of a program - runtime
-
- dep: perl [не sparc64]
- Larry Wall's Practical Extraction and Report Language
-
- dep: python3 [не sparc64]
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [не armel, armhf]
- compression library - runtime
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf]
-
- rec: python3-biopython
- Python3 library for bioinformatics
-
- rec: python3-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
Изтегляне на nanopolish
Архитектура | Версия | Големина на пакета | Големина след инсталиране | Файлове |
---|---|---|---|---|
alpha (неофициална архитектура) | 0.14.0-1+b1 | 2 133,7 кБ | 9 606,0 кБ | [списък на файловете] |
amd64 | 0.14.0-1+b1 | 2 144,8 кБ | 9 343,0 кБ | [списък на файловете] |
arm64 | 0.14.0-1+b1 | 2 073,9 кБ | 9 219,0 кБ | [списък на файловете] |
armel | 0.14.0-1+b1 | 2 078,6 кБ | 9 253,0 кБ | [списък на файловете] |
armhf | 0.14.0-1+b1 | 2 085,1 кБ | 8 861,0 кБ | [списък на файловете] |
hppa (неофициална архитектура) | 0.14.0-1+b1 | 2 149,1 кБ | 9 501,0 кБ | [списък на файловете] |
i386 | 0.14.0-1+b1 | 2 167,9 кБ | 9 413,0 кБ | [списък на файловете] |
ia64 (неофициална архитектура) | 0.14.0-1+b1 | 2 281,9 кБ | 10 820,0 кБ | [списък на файловете] |
m68k (неофициална архитектура) | 0.14.0-1+b1 | 2 117,9 кБ | 9 409,0 кБ | [списък на файловете] |
mips64el | 0.14.0-1+b1 | 2 105,4 кБ | 9 592,0 кБ | [списък на файловете] |
ppc64 (неофициална архитектура) | 0.13.3-2 | 2 208,6 кБ | 9 987,0 кБ | [списък на файловете] |
ppc64el | 0.14.0-1+b1 | 2 149,2 кБ | 9 603,0 кБ | [списък на файловете] |
riscv64 | 0.14.0-1+b2 | 2 150,1 кБ | 9 083,0 кБ | [списък на файловете] |
sh4 (неофициална архитектура) | 0.14.0-1+b1 | 2 257,1 кБ | 9 347,0 кБ | [списък на файловете] |
sparc64 (неофициална архитектура) | 0.5.0-1+b1 | 1 799,8 кБ | 3 490,0 кБ | [списък на файловете] |
x32 (неофициална архитектура) | 0.14.0-1+b1 | 2 144,4 кБ | 9 241,0 кБ | [списък на файловете] |