Paket: tantan (49-2)

[ Kaynak: tantan  ]

low complexity and tandem repeat masker for biosequences

tantan is a tool to mask simple regions (low complexity and short-period tandem repeats) in DNA, RNA, and protein sequences. The aim of tantan is to prevent false predictions when searching for homologous regions between two sequences. Simple repeats often align strongly to each other, causing false homology predictions.

Etiketler: Alan: Biyoloji, Biyoinformatik, Geliştirildiği dil: implemented-in::c++, interface::commandline, Rol: Program, Kapsam: scope::utility, works-with::biological-sequence

tantan ile İlgili Diğer Paketler

• dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, sh4 değil]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC support library

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC support library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4 değil]

  compression library - runtime

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

tantan indir

Tüm mevcut mimariler için indir

Mimari	Paket Boyutu	Kurulu Boyut	Dosyalar
alpha (resmi olmayan port)	39,0 kB	145,0 kB	[dosya listesi]
amd64	41,1 kB	120,0 kB	[dosya listesi]
arm64	37,1 kB	144,0 kB	[dosya listesi]
armel	36,9 kB	103,0 kB	[dosya listesi]
armhf	34,8 kB	79,0 kB	[dosya listesi]
hppa (resmi olmayan port)	39,5 kB	105,0 kB	[dosya listesi]
i386	43,5 kB	119,0 kB	[dosya listesi]
ia64 (resmi olmayan port)	51,1 kB	200,0 kB	[dosya listesi]
m68k (resmi olmayan port)	38,2 kB	111,0 kB	[dosya listesi]
mips64el	41,1 kB	149,0 kB	[dosya listesi]
ppc64 (resmi olmayan port)	44,0 kB	144,0 kB	[dosya listesi]
ppc64el	44,0 kB	144,0 kB	[dosya listesi]
riscv64	40,6 kB	92,0 kB	[dosya listesi]
s390x	44,2 kB	124,0 kB	[dosya listesi]
sh4 (resmi olmayan port)	47,7 kB	143,0 kB	[dosya listesi]
sparc64 (resmi olmayan port)	34,6 kB	1.042,0 kB	[dosya listesi]
x32 (resmi olmayan port)	41,1 kB	115,0 kB	[dosya listesi]