パッケージ: tantan (49-2)

[ ソース: tantan  ]

low complexity and tandem repeat masker for biosequences

tantan is a tool to mask simple regions (low complexity and short-period tandem repeats) in DNA, RNA, and protein sequences. The aim of tantan is to prevent false predictions when searching for homologous regions between two sequences. Simple repeats often align strongly to each other, causing false homology predictions.

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, 実装言語: implemented-in::c++, interface::commandline, 役割: プログラム, 対象範囲: scope::utility, works-with::biological-sequence

その他の tantan 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, sh4 以外]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4 以外]

  圧縮ライブラリ - ランタイム

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

tantan のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	39.0 kB	145.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	41.1 kB	120.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	37.1 kB	144.0 kB	[ファイル一覧]
armel	36.9 kB	103.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	34.8 kB	79.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	39.5 kB	105.0 kB	[ファイル一覧]
i386	43.5 kB	119.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	51.1 kB	200.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	38.2 kB	111.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	41.1 kB	149.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	44.0 kB	144.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	44.0 kB	144.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	40.6 kB	92.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	44.2 kB	124.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	47.7 kB	143.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	34.6 kB	1,042.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	41.1 kB	115.0 kB	[ファイル一覧]