Paket: abyss (2.3.7-3 ve diğerleri)

[ Kaynak: abyss  ]

de novo, parallel, sequence assembler for short reads

ABySS is a de novo, parallel, sequence assembler that is designed for short reads. It may be used to assemble genome or transcriptome sequence data. Parallelization is achieved using MPI, OpenMP and pthread.

Etiketler: Alan: Biyoloji, Geliştirildiği dil: C, Kullanıcı Arayüzü: Komut Satırı, Rol: Program

abyss ile İlgili Diğer Paketler

• dep: bsdextrautils [hppa, sparc64 değil]

  extra utilities from 4.4BSD-Lite

• dep: bsdmainutils [hppa, sparc64]

  Transitional package for more utilities from FreeBSD

• dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [sparc64]

  dep: libc6 (>= 2.32) [m68k, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, sparc64 değil]

• dep: libc6.1 (>= 2.33) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.35) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, x32]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, sh4]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC support library

• dep: libgcc1 (>= 1:4.3) [sparc64]

  Paket mevcut değil

• dep: libgcc4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Paket mevcut değil

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libopenmpi3 [sparc64]

  high performance message passing library -- shared library

  dep: libopenmpi3 (>= 4.1.2~rc1) [m68k, sh4]

  dep: libopenmpi3 (>= 4.1.4) [alpha, ia64, x32]

• dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  SQLite 3 shared library

• dep: libstdc++6 (>= 11) [m68k, sh4]

  GNU Standard C++ Library v3

  dep: libstdc++6 (>= 12) [alpha, ia64, x32]

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64]

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [hppa]

  dep: libstdc++6 (>= 9) [sparc64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: make

  utility for directing compilation

• dep: openmpi-bin [hppa değil]

  high performance message passing library -- binaries

• dep: openmpi-common [hppa değil]

  high performance message passing library -- common files

• dep: perl

  Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

• sug: openmpi-bin

  high performance message passing library -- binaries

abyss indir

Tüm mevcut mimariler için indir

Mimari	Sürüm	Paket Boyutu	Kurulu Boyut	Dosyalar
alpha (resmi olmayan port)	2.3.5+dfsg-2	3.091,4 kB	12.135,0 kB	[dosya listesi]
amd64	2.3.7-3+b1	3.188,0 kB	9.900,0 kB	[dosya listesi]
arm64	2.3.7-3+b1	2.960,1 kB	10.548,0 kB	[dosya listesi]
hppa (resmi olmayan port)	2.1.0-1	2.719,4 kB	9.671,0 kB	[dosya listesi]
ia64 (resmi olmayan port)	2.3.5+dfsg-2	3.493,2 kB	17.029,0 kB	[dosya listesi]
m68k (resmi olmayan port)	2.3.3-2	3.040,2 kB	9.799,0 kB	[dosya listesi]
mips64el	2.3.7-3+b1	3.074,6 kB	12.772,0 kB	[dosya listesi]
ppc64 (resmi olmayan port)	2.3.7-3+b1	3.101,8 kB	12.984,0 kB	[dosya listesi]
ppc64el	2.3.7-3+b1	3.123,3 kB	12.532,0 kB	[dosya listesi]
riscv64	2.3.7-3+b1	3.141,5 kB	8.296,0 kB	[dosya listesi]
sh4 (resmi olmayan port)	2.3.3-2	3.276,4 kB	9.167,0 kB	[dosya listesi]
sparc64 (resmi olmayan port)	2.2.2-1	2.718,5 kB	9.131,0 kB	[dosya listesi]
x32 (resmi olmayan port)	2.3.5+dfsg-2	3.104,9 kB	8.946,0 kB	[dosya listesi]