Пакет: tabix (1.22.1+ds2-1 и другие)

[ Источник: htslib  ]

generic indexer for TAB-delimited genome position files

Tabix indexes files where some columns indicate sequence coordinates: name (usually a chromosome), start and stop. The input data file must be position sorted and compressed by bgzip (provided in this package), which has a gzip like interface. After indexing, tabix is able to quickly retrieve data lines by chromosomal coordinates. Fast data retrieval also works over network if an URI is given as a file name.

This package is built from the HTSlib source, and provides the bgzip, htsfile, and tabix tools.

Теги: Реализовано на: C, Роль: Программа, Наука: science::calculation, use::calculating, Поддерживаемые форматы: HTML, язык гипертекстовой разметки, Работает с: Текст

Другие пакеты, относящиеся к tabix

• dep: libbz2-1.0

  библиотека сжатия по алгоритму Барроуза—Уилера (динамическая версия)

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, loong64, sh4]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.41) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  быстрое сжатие и распаковка блоков данных на основе DEFLATE

• dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)

  Custom compression for CRAM and others

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  библиотека для работы с архивами в формате XZ

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  библиотека сжатия

Загрузка tabix

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	1.22.1+ds2-1	496,8 Кб	2 770,0 Кб	[список файлов]
amd64	1.22.1+ds2-1	529,4 Кб	2 579,0 Кб	[список файлов]
arm64	1.22.1+ds2-1	458,0 Кб	2 319,0 Кб	[список файлов]
armel	1.22.1+ds2-1	418,8 Кб	2 252,0 Кб	[список файлов]
armhf	1.22.1+ds2-1	422,0 Кб	1 612,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	1.22.1+ds2-1	475,8 Кб	2 332,0 Кб	[список файлов]
i386	1.22.1+ds2-1	539,7 Кб	2 668,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	1.19+ds-1.1+b1	558,6 Кб	4 599,0 Кб	[список файлов]
loong64 (неофициальный перенос)	1.22.1+ds2-1	489,0 Кб	2 575,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	1.22.1+ds2-1	442,7 Кб	2 124,0 Кб	[список файлов]
mips64el	1.22.1+ds2-1	454,8 Кб	2 752,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	1.22.1+ds2-1	510,4 Кб	3 215,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	1.22.1+ds2-1	528,6 Кб	3 151,0 Кб	[список файлов]
riscv64	1.22.1+ds2-1	505,7 Кб	1 943,0 Кб	[список файлов]
s390x	1.22.1+ds2-1	479,9 Кб	2 527,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	1.22.1+ds2-1	509,8 Кб	2 063,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	1.22.1+ds2-1	415,6 Кб	3 166,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	1.22.1+ds2-1	493,3 Кб	2 312,0 Кб	[список файлов]