Balík: tabix (1.11-4)

[ Zdroj: htslib  ]

generic indexer for TAB-delimited genome position files

Tabix indexes files where some columns indicate sequence coordinates: name (usually a chromosome), start and stop. The input data file must be position sorted and compressed by bgzip (provided in this package), which has a gzip like interface. After indexing, tabix is able to quickly retrieve data lines by chromosomal coordinates. Fast data retrieval also works over network if an URI is given as a file name.

This package is built from the HTSlib source, and provides the bgzip, htsfile, and tabix tools.

Značky: Implementované v: C, Role: Program, Veda: science::calculation, use::calculating, Supports Format: HTML, Hypertext Markup Language, Works with: Text

Ostatné balíky súvisiace s balíkom tabix

• dep: libbz2-1.0

  kvalitná knižnica na komprimáciu súborov s triedením blokov - dynamická knižnica

• dep: libc6 (>= 2.15) [nie alpha, arm64, ppc64el, riscv64, sh4, x32]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.15) [alpha]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  fast, whole-buffer DEFLATE-based compression and decompression

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  komprimačná knižnica formátu XZ

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť tabix

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	362.3 kB	1,358.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	330.7 kB	1,087.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	308.5 kB	1,011.0 kB	[zoznam súborov]
armel	293.1 kB	1,004.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	298.7 kB	728.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	339.5 kB	1,111.0 kB	[zoznam súborov]
i386	360.7 kB	1,200.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	306.6 kB	1,040.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	312.8 kB	1,240.0 kB	[zoznam súborov]
mipsel	327.7 kB	1,215.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	351.9 kB	1,467.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	358.6 kB	1,467.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64 (neoficiálny port)	311.4 kB	802.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	301.7 kB	1,151.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	373.9 kB	947.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	296.3 kB	1,094.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	332.1 kB	1,048.0 kB	[zoznam súborov]