[ Источник: gmap ]
Пакет: gmap (2025-07-31+ds-1 и другие)
Ссылки для gmap
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код gmap:
Сопровождающие:
- Debian Med Packaging Team (Страница КК, Почтовый архив)
- Shaun Jackman (Страница КК)
- Andreas Tille (Страница КК)
- Alexandre Mestiashvili (Страница КК)
- Étienne Mollier (Страница КК)
Внешние ресурсы:
- Сайт [research-pub.gene.com]
Подобные пакеты:
spliced and SNP-tolerant alignment for mRNA and short reads
This package contains the programs GMAP and GSNAP as well as utilities to manage genome databases in GMAP/GSNAP format. GMAP (Genomic Mapping and Alignment Program) is a tool for aligning EST, mRNA and cDNA sequences. GSNAP (Genomic Short-read Nucleotide Alignment Program) is a tool for aligning single-end and paired-end transcriptome reads. Both tools can use a database of
* known splice sites and identify novel splice sites. * known single-nucleotide polymorphisms (SNPs).GSNAP can align bisulfite-treated DNA.
Другие пакеты, относящиеся к gmap
|
|
|
|
-
- dep: libbz2-1.0
- библиотека сжатия по алгоритму Барроуза—Уилера (динамическая версия)
-
- dep: libc6 (>= 2.38) [не alpha, loong64, sh4]
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.42) [loong64]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb
-
- dep: perl
- практический язык Ларри Уолла для извлечения данных и составления отчётов
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
- библиотека сжатия
Загрузка gmap
| Архитектура | Версия | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|---|
| alpha (неофициальный перенос) | 2025-07-31+ds-1 | 5 331,8 Кб | 44 665,0 Кб | [список файлов] |
| amd64 | 2025-07-31+ds-1 | 35 600,9 Кб | 269 708,0 Кб | [список файлов] |
| arm64 | 2025-07-31+ds-1+b1 | 6 970,4 Кб | 61 224,0 Кб | [список файлов] |
| armhf | 2025-07-31+ds-1 | 4 889,4 Кб | 44 881,0 Кб | [список файлов] |
| i386 | 2025-07-31+ds-1 | 5 133,3 Кб | 46 585,0 Кб | [список файлов] |
| loong64 | 2025-07-31+ds-1 | 6 968,3 Кб | 62 243,0 Кб | [список файлов] |
| ppc64el | 2025-07-31+ds-1 | 7 144,1 Кб | 63 848,0 Кб | [список файлов] |
| riscv64 | 2025-07-31+ds-1 | 6 331,5 Кб | 59 216,0 Кб | [список файлов] |
| sh4 (неофициальный перенос) | 2024-11-20+ds-2 | 5 697,4 Кб | 48 642,0 Кб | [список файлов] |
| x32 (неофициальный перенос) | 2025-07-31+ds-1 | 5 605,1 Кб | 47 873,0 Кб | [список файлов] |