[ Quellcode: gmap ]
Paket: gmap (2025-07-31+ds-1 und andere)
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Betreuer:
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Externe Ressourcen:
- Homepage [research-pub.gene.com]
Ähnliche Pakete:
spliced and SNP-tolerant alignment for mRNA and short reads
This package contains the programs GMAP and GSNAP as well as utilities to manage genome databases in GMAP/GSNAP format. GMAP (Genomic Mapping and Alignment Program) is a tool for aligning EST, mRNA and cDNA sequences. GSNAP (Genomic Short-read Nucleotide Alignment Program) is a tool for aligning single-end and paired-end transcriptome reads. Both tools can use a database of
* known splice sites and identify novel splice sites. * known single-nucleotide polymorphisms (SNPs).GSNAP can align bisulfite-treated DNA.
Andere Pakete mit Bezug zu gmap
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- dep: libbz2-1.0
- Hochwertiger, Blöcke sortierender Dateikomprimierer - Laufzeitbibliothek
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- dep: libc6 (>= 2.38) [nicht alpha, loong64, sh4]
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.42) [loong64]
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- dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb
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- dep: perl
- Larry Wall's Practical Extraction und Report Language
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- dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
- Kompressions-Bibliothek - Laufzeit
gmap herunterladen
| Architektur | Version | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
|---|---|---|---|---|
| alpha (inoffizielle Portierung) | 2025-07-31+ds-1 | 5.331,8 kB | 44.665,0 kB | [Liste der Dateien] |
| amd64 | 2025-07-31+ds-1 | 35.600,9 kB | 269.708,0 kB | [Liste der Dateien] |
| arm64 | 2025-07-31+ds-1+b1 | 6.970,4 kB | 61.224,0 kB | [Liste der Dateien] |
| armhf | 2025-07-31+ds-1 | 4.889,4 kB | 44.881,0 kB | [Liste der Dateien] |
| i386 | 2025-07-31+ds-1 | 5.133,3 kB | 46.585,0 kB | [Liste der Dateien] |
| loong64 | 2025-07-31+ds-1 | 6.968,3 kB | 62.243,0 kB | [Liste der Dateien] |
| ppc64el | 2025-07-31+ds-1 | 7.144,1 kB | 63.848,0 kB | [Liste der Dateien] |
| riscv64 | 2025-07-31+ds-1 | 6.331,5 kB | 59.216,0 kB | [Liste der Dateien] |
| sh4 (inoffizielle Portierung) | 2024-11-20+ds-2 | 5.697,4 kB | 48.642,0 kB | [Liste der Dateien] |
| x32 (inoffizielle Portierung) | 2025-07-31+ds-1 | 5.605,1 kB | 47.873,0 kB | [Liste der Dateien] |