Пакет: libbifrost-dev (1.3.5-2)

[ Источник: bifrost  ]

static library and header files for libbifrost

Libbifrost-dev is the development library for the command-line tool bifrost for sequencing that features a broad range of functions, such as indexing, editing, and querying the graph, and includes a graph coloring method that maps each k-mer of the graph to the genomes it occurs in.

 * Build, index, color and query the compacted de Bruijn graph
 * No need to build the uncompacted de Bruijn graph
 * Reads or assembled genomes as input
 * Output graph in GFA (can be visualized with Bandage), FASTA or binary
 * Graph cleaning: short tip clipping, etc.
 * Multi-threaded
 * No parameters to estimate with other tools
 * Exact or approximate k-mer search of queries

Другие пакеты, относящиеся к libbifrost-dev

• dep: libbifrost0 (= 1.3.5-2)

  library for parallel construction, indexing and querying of de Bruijn graphs

Загрузка libbifrost-dev

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	629,7 Кб	4 029,0 Кб	[список файлов]
arm64	608,6 Кб	4 021,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	663,9 Кб	4 282,0 Кб	[список файлов]
riscv64	2 555,7 Кб	30 133,0 Кб	[список файлов]
s390x	661,8 Кб	4 212,0 Кб	[список файлов]